30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0205 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0205  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 511 aa  1024    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  26.08 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 520 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 520 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2407  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 601 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  23.56 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  22.38 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  22.64 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 575 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  17.71 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 		 530 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.55 
 
 		 507 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  22.57 
 
 		 519 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2409  lipopolysaccharide biosynthesis  34.21 
 
 		 424 aa  54.7  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.79 
 
 		 642 aa  54.3  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  26.95 
 
 		 736 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.27 
 
 		 643 aa  53.5  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.1 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  19.04 
 
 		 490 aa  50.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  17.77 
 
 		 474 aa  50.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4786  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 		 519 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  21.7 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  19.57 
 
 		 532 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 522 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.09 
 
 		 520 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4239  lipopolysaccharide biosynthesis  21.82 
 
 		 517 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  22.47 
 
 		 684 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  28.72 
 
 		 758 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 738 aa  43.5  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>