More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0135 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 156 aa  313  8e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  50.74 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.74 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  50.74 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.48 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  43.08 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  43.97 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.65 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.63 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  41.18 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  41.3 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  40.65 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  41.41 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  39.86 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.22 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  40.46 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  41.84 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.5 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  44.62 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3472  protein TolR  43.07 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.14 
 
 		 136 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.61 
 
 		 139 aa  97.1  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  42.31 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.16 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.94 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  38.17 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  42.11 
 
 		 139 aa  94  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  40.31 
 
 		 146 aa  94  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.2 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.39 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.77 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.6 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.81 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.94 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  39.84 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  36.13 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  36.13 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  37.5 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.27 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  40.5 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  37.4 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.7 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.5 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0825  TonB system transport protein ExbD  36.15 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.027584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.88 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  30.94 
 
 		 139 aa  87.8  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  36.21 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.5 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  35.77 
 
 		 167 aa  87.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.08 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.08 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.08 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.08 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.08 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.08 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4274  TonB system transport protein ExbD type-1  37.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0093154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  34.46 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.08 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  32.31 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  34.85 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  34.85 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  33.08 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.21 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.54 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.02 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  33.87 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  37.78 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  37.78 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  33.06 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  34.48 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  36.44 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  34.85 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.69 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.38 
 
 		 145 aa  85.1  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  35 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  42.11 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  42.11 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.31 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  37.4 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  37.4 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  35.34 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.4 
 
 		 144 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.67 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  34.48 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  34.48 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.72 
 
 		 144 aa  84  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  32.31 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>