More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3409 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3409  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
365 aa  744    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.137332  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 
349 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  28.13 
 
 
341 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  31.97 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  22.03 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0048  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  23.77 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.7 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.66 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  33.1 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.22 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0114  oxidoreductase domain-containing protein  25.46 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  34.27 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.33 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.86 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4660  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3733  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  23.03 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  21.13 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  28.92 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.81 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  34.07 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.48 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 
344 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  23.32 
 
 
356 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  24.65 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  29.09 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  23.44 
 
 
435 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  22.19 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  22.19 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  28.48 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.82 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  28.48 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  26.5 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  28.48 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.82 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  28.48 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
329 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  28.48 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 
363 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  24.43 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  35.9 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.36 
 
 
357 aa  64.3  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.93 
 
 
404 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  23.86 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3940  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 
316 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0963887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  20.54 
 
 
365 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  28.28 
 
 
367 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  33.08 
 
 
342 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  24.52 
 
 
375 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  28.28 
 
 
367 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 
369 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 
364 aa  63.2  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  29.24 
 
 
366 aa  62.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.65 
 
 
359 aa  63.2  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
347 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  28.28 
 
 
367 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  34.82 
 
 
344 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  28.28 
 
 
367 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 
311 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  23.28 
 
 
334 aa  62.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  27.07 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
350 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 
357 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  19.32 
 
 
468 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>