More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2524 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2524  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
520 aa  1038    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.82155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  41.59 
 
 
499 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  43.13 
 
 
512 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  41.95 
 
 
515 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0135  AMP-dependent synthetase and ligase  44.3 
 
 
533 aa  372  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  40.44 
 
 
554 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  41.6 
 
 
513 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1578  AMP-dependent synthetase and ligase  43.62 
 
 
528 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.24195  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  40.55 
 
 
505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  39.73 
 
 
501 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.59 
 
 
529 aa  318  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  33.14 
 
 
496 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  33.14 
 
 
496 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  32.94 
 
 
496 aa  316  8e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 
496 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 
508 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.51 
 
 
503 aa  312  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 
508 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  36.08 
 
 
516 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 
508 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  40.44 
 
 
620 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 
491 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 
501 aa  293  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 
517 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 
509 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.33 
 
 
517 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.33 
 
 
517 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.33 
 
 
517 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 
496 aa  283  6.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
518 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 
528 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 
527 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 
517 aa  264  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  34.75 
 
 
503 aa  263  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.53 
 
 
514 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 
501 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0218  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 
501 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 
523 aa  255  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 
520 aa  250  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.74 
 
 
525 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 
509 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1016  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 
507 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0745502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 
525 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 
525 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  33.13 
 
 
490 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 
520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 
511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 
530 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 
526 aa  243  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 
532 aa  242  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 
518 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
516 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 
525 aa  242  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.01 
 
 
519 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
520 aa  240  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  31.3 
 
 
500 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  34.29 
 
 
512 aa  239  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  31.18 
 
 
500 aa  239  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  32.11 
 
 
532 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 
551 aa  239  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.19 
 
 
510 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.2 
 
 
486 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 
521 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.99 
 
 
510 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  31.34 
 
 
500 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
530 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.24 
 
 
526 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 
518 aa  237  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  32.34 
 
 
499 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.81 
 
 
510 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.81 
 
 
510 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.81 
 
 
510 aa  236  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.52 
 
 
512 aa  236  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.6 
 
 
510 aa  236  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 
510 aa  236  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  30.95 
 
 
500 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.81 
 
 
510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  30.95 
 
 
500 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 
519 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.63 
 
 
518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.41 
 
 
510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.01 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.34 
 
 
526 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
662 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.62 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  31.39 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6078  acyl-CoA synthetase  33.46 
 
 
536 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 
506 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  34.17 
 
 
556 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.37 
 
 
497 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 
520 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.16 
 
 
525 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  31.47 
 
 
533 aa  233  9e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
862 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  31.79 
 
 
544 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.8 
 
 
524 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 
1043 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 
527 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 
526 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 
490 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>