More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2368 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2368  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 445 aa  878    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2776  DNA-directed DNA polymerase  64.82 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285612  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0629  DNA-directed DNA polymerase  60.93 
 
 		 542 aa  455  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2100  DNA-directed DNA polymerase  57.52 
 
 		 443 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2466  UMUC domain protein DNA-repair protein  59.36 
 
 		 476 aa  442  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.666562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  41.94 
 
 		 360 aa  244  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  38.58 
 
 		 365 aa  232  9e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 		 354 aa  223  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  36.8 
 
 		 367 aa  213  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0642  DNA-directed DNA polymerase  34.05 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  39.18 
 
 		 380 aa  206  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  38.67 
 
 		 363 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  37.05 
 
 		 378 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  32.14 
 
 		 345 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 		 384 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  35.52 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  36.49 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  38.87 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  36.59 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  37.91 
 
 		 356 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  35.44 
 
 		 372 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  36.78 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  33.67 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  38.24 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  35.42 
 
 		 365 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  36.59 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0560  DNA polymerase IV  33.6 
 
 		 365 aa  193  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 		 374 aa  193  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  37.6 
 
 		 466 aa  193  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 		 385 aa  192  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  37.99 
 
 		 360 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  35.29 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  35.87 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2166  DNA-directed DNA polymerase  33.69 
 
 		 364 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 		 436 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  34.25 
 
 		 371 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  40.52 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  40.52 
 
 		 357 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  36.31 
 
 		 359 aa  188  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  34.31 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  37.05 
 
 		 376 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  33.7 
 
 		 358 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  35.99 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 		 420 aa  186  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  32.68 
 
 		 359 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  35.26 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  38.63 
 
 		 378 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  36.24 
 
 		 424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  33.33 
 
 		 399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  37.11 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  33.61 
 
 		 363 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  38.63 
 
 		 378 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  38.62 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  40.72 
 
 		 362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  34.93 
 
 		 430 aa  183  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  35.33 
 
 		 408 aa  183  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  32.29 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  34.27 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  33.98 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  33.16 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  34.27 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  37.8 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  34.5 
 
 		 371 aa  182  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  30.83 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  38.72 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  33.6 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  30.83 
 
 		 412 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  38.35 
 
 		 355 aa  180  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  33.97 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  35.47 
 
 		 354 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  33.43 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  42.34 
 
 		 369 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  30.83 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  30.29 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  30.29 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  30.29 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  36.17 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  31.93 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  31.9 
 
 		 353 aa  179  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  37.02 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  30.29 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  29.95 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  34.06 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  30.56 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  36.11 
 
 		 353 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  33.66 
 
 		 834 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  32.96 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  30.03 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  35.77 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  38.42 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  34.65 
 
 		 430 aa  177  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  35.21 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  32.88 
 
 		 357 aa  177  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  33.89 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  33.61 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  35.21 
 
 		 361 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>