35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2195 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  54.68 
 
 		 725 aa  705    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  56.23 
 
 		 730 aa  728    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 731 aa  1435    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  55.2 
 
 		 735 aa  734    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  58.04 
 
 		 732 aa  511  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  33.73 
 
 		 637 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  34.12 
 
 		 634 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  32.06 
 
 		 611 aa  250  7e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  31.94 
 
 		 707 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  33.2 
 
 		 636 aa  239  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  32.33 
 
 		 710 aa  233  9e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  31.21 
 
 		 611 aa  232  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  29.67 
 
 		 722 aa  226  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  32.52 
 
 		 648 aa  223  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  31.2 
 
 		 612 aa  221  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  29.52 
 
 		 612 aa  220  6e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  29.48 
 
 		 612 aa  218  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  32.87 
 
 		 641 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  29.77 
 
 		 761 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  29.77 
 
 		 761 aa  208  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  28.49 
 
 		 758 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  29.9 
 
 		 761 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  28.87 
 
 		 761 aa  189  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.94 
 
 		 749 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.28 
 
 		 721 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.94 
 
 		 721 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  35.71 
 
 		 491 aa  45.8  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.76 
 
 		 514 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  29.08 
 
 		 527 aa  45.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.76 
 
 		 503 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2976  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.88 
 
 		 696 aa  44.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.31401e-17 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1652  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.53 
 
 		 702 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1308  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.88 
 
 		 696 aa  44.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00697732  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1934  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.53 
 
 		 702 aa  43.9  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1167  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  35.71 
 
 		 698 aa  43.9  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>