19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0817 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  69.35 
 
 
514 aa  764    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  74 
 
 
517 aa  797    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
527 aa  1079    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  69.39 
 
 
537 aa  746    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  63.16 
 
 
588 aa  742    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  43.9 
 
 
674 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  46.94 
 
 
474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  44.27 
 
 
594 aa  349  8e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  44.11 
 
 
467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  36.5 
 
 
487 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  42.24 
 
 
465 aa  334  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  43.87 
 
 
467 aa  334  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  44.42 
 
 
578 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  43.91 
 
 
584 aa  327  3e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  43.91 
 
 
583 aa  326  5e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  42.38 
 
 
471 aa  324  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  39.49 
 
 
640 aa  318  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  37.34 
 
 
466 aa  296  7e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  34.02 
 
 
481 aa  243  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>