More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2318 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 
241 aa  486  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  73.97 
 
 
242 aa  365  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  73.97 
 
 
242 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  69.29 
 
 
241 aa  347  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0507  purine or other phosphorylase family 1  48.17 
 
 
274 aa  194  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  42.98 
 
 
293 aa  193  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  44.59 
 
 
272 aa  190  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  45.15 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  46.15 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  39.2 
 
 
258 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  43.89 
 
 
278 aa  184  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  41.74 
 
 
275 aa  181  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  37.2 
 
 
252 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  37.6 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  37.6 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  39.04 
 
 
290 aa  166  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  35.66 
 
 
244 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  35.43 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  40.62 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  36.22 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  36.22 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  36.22 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  37.81 
 
 
243 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
253 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3390  uridine phosphorylase  36.51 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467764  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5272  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.25692  normal  0.111968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4303  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4177  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0246384 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
254 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  37.34 
 
 
252 aa  162  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  36.22 
 
 
256 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  37.34 
 
 
252 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  37.34 
 
 
252 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  37.34 
 
 
252 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4208  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
254 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000492697 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4148  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
253 aa  161  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  35.83 
 
 
253 aa  161  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
253 aa  161  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  38.69 
 
 
243 aa  161  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1597  uridine phosphorylase  38.84 
 
 
261 aa  161  7e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.585092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
253 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
253 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
253 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
253 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  35.83 
 
 
253 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0488  uridine phosphorylase  36.51 
 
 
252 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000843993  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  36.93 
 
 
252 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0467  uridine phosphorylase  36.51 
 
 
252 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0491  uridine phosphorylase  36.51 
 
 
252 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000989651  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0187  uridine phosphorylase  35.77 
 
 
252 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  36.1 
 
 
252 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0461  uridine phosphorylase  36.93 
 
 
252 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137715  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  36.44 
 
 
250 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3852  uridine phosphorylase  36.51 
 
 
252 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4509  uridine phosphorylase  36.51 
 
 
252 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  41.98 
 
 
259 aa  159  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  36.51 
 
 
252 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  39.07 
 
 
256 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1519  uridine phosphorylase  35.78 
 
 
252 aa  159  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  35.66 
 
 
244 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  35.66 
 
 
244 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  37.1 
 
 
252 aa  158  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  36.1 
 
 
252 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  38.69 
 
 
243 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  36.63 
 
 
239 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  36.95 
 
 
271 aa  155  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0469  uridine phosphorylase  36.36 
 
 
261 aa  155  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0396786  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  36.78 
 
 
261 aa  155  4e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  38.5 
 
 
247 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3932  uridine phosphorylase  34.94 
 
 
253 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  38 
 
 
247 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  37.56 
 
 
261 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  37.09 
 
 
261 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  36.18 
 
 
243 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  35.94 
 
 
238 aa  152  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2868  uridine phosphorylase  34.44 
 
 
252 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  37.28 
 
 
236 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  35.95 
 
 
241 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1651  uridine phosphorylase  35.63 
 
 
258 aa  148  6e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  35.68 
 
 
263 aa  148  9e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  33.61 
 
 
240 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  33.82 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  35.54 
 
 
241 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  36.89 
 
 
248 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  36.41 
 
 
238 aa  138  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0900  uridine phosphorylase  33.62 
 
 
238 aa  136  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.768164  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1596  purine phosphorylases family protein 1  32.92 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0062  purine phosphorylases family protein 1  33.49 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  30.17 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4885  purine or other phosphorylase family 1  36.89 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.620121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3375  purine nucleoside phosphorylase  32.39 
 
 
236 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.284651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1978  purine nucleoside phosphorylase  30.34 
 
 
234 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331725  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1513  purine-nucleoside phosphorylase  34.4 
 
 
243 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0821603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0602  purine nucleoside phosphorylase  30.8 
 
 
239 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0824  purine nucleoside phosphorylase  32.54 
 
 
239 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.02467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1925  purine nucleoside phosphorylase  31.1 
 
 
235 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3546  purine nucleoside phosphorylase  30.42 
 
 
236 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.799796  hitchhiker  0.000820133 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2832  purine nucleoside phosphorylase  31.03 
 
 
235 aa  121  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  28.69 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>