261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000334 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  82.64 
 
 		 243 aa  420  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  67.54 
 
 		 243 aa  329  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  65.7 
 
 		 243 aa  321  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  56.38 
 
 		 244 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  56.38 
 
 		 244 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  56.38 
 
 		 244 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  56.9 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  56.07 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0900  uridine phosphorylase  46.19 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.768164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  44.63 
 
 		 247 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  44.63 
 
 		 247 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  39.7 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  38.69 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  38.69 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  36.68 
 
 		 241 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  37.39 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  40.85 
 
 		 275 aa  143  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  36.94 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  37.7 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  38.53 
 
 		 290 aa  137  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  34.8 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  36.33 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  35.41 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  38.46 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  34.21 
 
 		 275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  38.92 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  37.5 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0507  purine or other phosphorylase family 1  37.5 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  33.49 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1519  uridine phosphorylase  32.8 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0488  uridine phosphorylase  34.21 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000843993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0467  uridine phosphorylase  34.21 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0491  uridine phosphorylase  34.21 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000989651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3852  uridine phosphorylase  34.21 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4303  uridine phosphorylase  32.26 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  32.26 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5272  uridine phosphorylase  32.26 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.25692  normal  0.111968 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4177  uridine phosphorylase  32.26 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0246384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  33.33 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  32.26 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4148  uridine phosphorylase  32.26 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4208  uridine phosphorylase  32.26 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000492697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  32.26 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  33.49 
 
 		 252 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  32.26 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  33.49 
 
 		 283 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  34.4 
 
 		 258 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  33.33 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  33.63 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  33.63 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  33.63 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  33.2 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  36.36 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  33.84 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  37.76 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2868  uridine phosphorylase  34.08 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  34.08 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  32.46 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0461  uridine phosphorylase  34.51 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0187  uridine phosphorylase  32.26 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  31.45 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  31.45 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  31.45 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  31.45 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  31.45 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  31.45 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3390  uridine phosphorylase  31.84 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  33.03 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  37.06 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  32.74 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  32.57 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4509  uridine phosphorylase  32.74 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  32.57 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  30.65 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  32.57 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  31.49 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0910  purine or other phosphorylase family 1  35.44 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303015  normal  0.357288 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  33.16 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1572  purine phosphorylases family protein 1  34.8 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3932  uridine phosphorylase  32.74 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  33.66 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1081  purine or other phosphorylase family 1  32.62 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  32.83 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1597  uridine phosphorylase  37.06 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.585092 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0469  uridine phosphorylase  37.65 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0396786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0603  purine phosphorylase family 1  35.15 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1596  purine phosphorylases family protein 1  34.54 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  33.65 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  38.24 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  32.5 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0127  purine nucleoside phosphorylase  37.57 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0122  purine nucleoside phosphorylase  37.57 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000853984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4885  purine or other phosphorylase family 1  33.96 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.620121  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1651  uridine phosphorylase  37.06 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  30.37 
 
 		 263 aa  108  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  36.82 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  36.32 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1391  purine nucleoside phosphorylase  36.82 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000867516  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0092  purine nucleoside phosphorylase  34.29 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>