261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0004 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  67.22 
 
 		 243 aa  340  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  65.56 
 
 		 243 aa  330  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  64.02 
 
 		 243 aa  319  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  56.49 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  56.07 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  56.43 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  56.43 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  56.43 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  42.62 
 
 		 247 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  42.62 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0900  uridine phosphorylase  42.02 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.768164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  39.2 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  33.88 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  37.81 
 
 		 242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  35.18 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  34.78 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  34.83 
 
 		 241 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  38.97 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  33.97 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  34.48 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  34.48 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  38 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  37.56 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  33.99 
 
 		 258 aa  134  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  36.46 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3390  uridine phosphorylase  33.33 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0488  uridine phosphorylase  35.68 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000843993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0467  uridine phosphorylase  35.68 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0491  uridine phosphorylase  35.68 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000989651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3852  uridine phosphorylase  35.68 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  36.45 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  36.18 
 
 		 252 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0507  purine or other phosphorylase family 1  37.74 
 
 		 274 aa  131  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  34.67 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  34.67 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  34.67 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  34.67 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  37.62 
 
 		 290 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  34.67 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  36.02 
 
 		 275 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  35.83 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2868  uridine phosphorylase  35.68 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  37.5 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  36.32 
 
 		 278 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1519  uridine phosphorylase  33.19 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  37.82 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  34.48 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  33.99 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3932  uridine phosphorylase  34.45 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0461  uridine phosphorylase  34.67 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  35.1 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  30.54 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4148  uridine phosphorylase  30.54 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4208  uridine phosphorylase  30.54 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000492697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5272  uridine phosphorylase  30.54 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.25692  normal  0.111968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  30.54 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  35.71 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4303  uridine phosphorylase  30.54 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4177  uridine phosphorylase  30.54 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0246384 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  30.54 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  30.54 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  32.84 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  32.23 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0187  uridine phosphorylase  31.98 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  33.17 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4509  uridine phosphorylase  33.99 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  32.68 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  32.68 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  32.68 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  33.49 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  31.22 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  36.28 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  32.77 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  32.06 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  32.54 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1596  purine phosphorylases family protein 1  36.6 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  34.38 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1597  uridine phosphorylase  35.75 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.585092 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  31.51 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  31.88 
 
 		 248 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  29.55 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  29.55 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  29.55 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  29.55 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  29.55 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1081  purine or other phosphorylase family 1  29.71 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  36.23 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0469  uridine phosphorylase  34.78 
 
 		 261 aa  108  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0396786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4885  purine or other phosphorylase family 1  36.79 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.620121  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1572  purine phosphorylases family protein 1  34.52 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1651  uridine phosphorylase  34.78 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0603  purine phosphorylase family 1  36.73 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0910  purine or other phosphorylase family 1  33.84 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303015  normal  0.357288 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  33.66 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0062  purine phosphorylases family protein 1  32.51 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2420  purine nucleoside phosphorylase  33.66 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1391  purine nucleoside phosphorylase  33.66 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000867516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2832  purine nucleoside phosphorylase  32.52 
 
 		 235 aa  98.6  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0610  purine phosphorylases family protein 1  35.47 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.807102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>