51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0440 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  434  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  43.5 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  42.06 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  41.41 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  46.29 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  37.27 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  43.13 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  36.49 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  41.59 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  43.11 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  34.98 
 
 		 245 aa  128  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  32.77 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  33.05 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  32.91 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  34.98 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  33.05 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  33.06 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  32.64 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  36.17 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  32.64 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  33.05 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  33.05 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  33.05 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  33.19 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  33.05 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  32.23 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  35.43 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  33.79 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  34.07 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  35.56 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  33.04 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  33.18 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  33.06 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  38.1 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  37.22 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  36.11 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  36.59 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  32.23 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  36.72 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  28.74 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  32.83 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  28.83 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  28.83 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  25.42 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  27.59 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  25.42 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  25.42 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  26.19 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  32.35 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>