108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0052 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3504  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t43  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0642422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA33  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.962701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0041  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.264208 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41320  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73657  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0010  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.102208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0054  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.875757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0043  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000413572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0056  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.756385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000872679  normal  0.444657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  83.87 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0037  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21797  normal  0.0832006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0055  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.796576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0002  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  96.15 
 
 		 1389 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309067  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.086825  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309118  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.253847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309143  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0038  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00398477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0039  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00836126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>