More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3391 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  43.81 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  44.25 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  43.61 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  43.61 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  43.61 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  43.61 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  43.61 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  43.61 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  43.61 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  43.61 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  43.61 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 246 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  41.53 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  43.64 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1071  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.9 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.79 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  43.16 
 
 		 269 aa  178  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.24 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.87 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 253 aa  177  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  40.35 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  41.95 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  39.91 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  42.04 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.7 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.04 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  43.89 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  40.83 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.83 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.83 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  40.83 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  40.83 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  40.83 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  41.59 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  43.35 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  40.93 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  40.42 
 
 		 239 aa  174  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 237 aa  174  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 248 aa  174  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 226 aa  174  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  40.51 
 
 		 248 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.64 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  40.08 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  43.61 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  40.08 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1135  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 234 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 234 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>