47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0596 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0596  UspA domain-containing protein  100 
 
 
276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3007  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2033  UspA domain-containing protein  34.76 
 
 
271 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3791  UspA domain protein  28.92 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0160832 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  22.68 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  28.06 
 
 
151 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  27.69 
 
 
154 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  33.33 
 
 
143 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  25.26 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  28.83 
 
 
217 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  26.03 
 
 
155 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  28.21 
 
 
143 aa  46.2  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  25.69 
 
 
140 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  24.32 
 
 
309 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 
145 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.63 
 
 
142 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 
141 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  25 
 
 
820 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  25.34 
 
 
155 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  33.9 
 
 
148 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  35.71 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  28.23 
 
 
156 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  27.78 
 
 
136 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  25.34 
 
 
155 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  25.34 
 
 
155 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  25.34 
 
 
155 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  25.34 
 
 
155 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  33.82 
 
 
155 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.85 
 
 
138 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  22.82 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  28.35 
 
 
159 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  25.76 
 
 
180 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  22.5 
 
 
632 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  21.23 
 
 
155 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  21.23 
 
 
155 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  21.23 
 
 
155 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
140 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  25.83 
 
 
141 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 
145 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  27.48 
 
 
148 aa  42.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  24.66 
 
 
155 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  24.08 
 
 
281 aa  42.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 
147 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  22.82 
 
 
732 aa  42  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  29.27 
 
 
625 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>