106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1293 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  100 
 
 
80 aa  164  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  66.23 
 
 
77 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  44.44 
 
 
82 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  41.98 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  42.11 
 
 
78 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  36.36 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  36.36 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  37.14 
 
 
76 aa  60.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  37.97 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  39.44 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  38.67 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  35.14 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  37.5 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  35 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  37.18 
 
 
78 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  37.14 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  35.29 
 
 
82 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  32.86 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  32.31 
 
 
73 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  37.97 
 
 
80 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.43 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  31.43 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  39.68 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  32.86 
 
 
70 aa  48.9  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  45.45 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  32.43 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  32.43 
 
 
92 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  40.3 
 
 
76 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  29.87 
 
 
92 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  34.29 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00171  hypothetical protein  37.7 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46492  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1262  SirA family protein  36.62 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1345  hypothetical protein  36.07 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  30.43 
 
 
74 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  31.43 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  31.43 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  30.3 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0447  SirA-like  28.99 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  27.78 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  40.74 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  40.74 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  27.78 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  37.68 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  30.43 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  29.87 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  29.87 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  29.87 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  38.36 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  29.87 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  27.78 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  29.87 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  25.71 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  29.87 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  29.58 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  29.87 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  30.77 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  29.33 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  28 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  30.77 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  29.17 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  28 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  28.57 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22790  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.43 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  36.21 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  38.18 
 
 
89 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  30.77 
 
 
75 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  32.2 
 
 
78 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  32.86 
 
 
796 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  27.03 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  28.57 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  28.57 
 
 
70 aa  41.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  27.63 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  35.14 
 
 
85 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  28 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  38.18 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  26.67 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  32.2 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  32.2 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0330  SirA family protein  31.94 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  36.84 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  34.55 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1822  redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.57 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  35.59 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  28.36 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  30.88 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  30.88 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  30.88 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  30.88 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  30.88 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  30.88 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>