More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1357 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  73.47 
 
 		 198 aa  297  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  72.45 
 
 		 198 aa  295  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  72.45 
 
 		 197 aa  292  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  72.96 
 
 		 198 aa  292  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  71.88 
 
 		 198 aa  286  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  70.92 
 
 		 198 aa  286  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  70.92 
 
 		 198 aa  286  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  71.88 
 
 		 198 aa  286  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  71.88 
 
 		 198 aa  286  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  72.4 
 
 		 198 aa  286  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  72.4 
 
 		 198 aa  286  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  71.88 
 
 		 198 aa  285  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  70.92 
 
 		 198 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  72.4 
 
 		 198 aa  285  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  72.4 
 
 		 198 aa  285  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  72.4 
 
 		 198 aa  285  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  72.4 
 
 		 198 aa  284  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  70.41 
 
 		 198 aa  284  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  71.88 
 
 		 198 aa  283  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  71.88 
 
 		 198 aa  283  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  71.88 
 
 		 198 aa  283  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  71.88 
 
 		 198 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  71.88 
 
 		 198 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  69.95 
 
 		 211 aa  280  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  68.29 
 
 		 217 aa  279  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  69.43 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  68.21 
 
 		 204 aa  276  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  66.84 
 
 		 207 aa  265  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  69.73 
 
 		 190 aa  265  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  69.95 
 
 		 203 aa  257  7e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  67.57 
 
 		 206 aa  257  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  68.42 
 
 		 214 aa  255  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  68.85 
 
 		 197 aa  252  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  65.95 
 
 		 201 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  65.24 
 
 		 201 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  65.41 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  65.24 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  66.84 
 
 		 208 aa  248  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  65.78 
 
 		 227 aa  245  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  63.3 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  65.97 
 
 		 213 aa  239  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  67.78 
 
 		 212 aa  235  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  64.29 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  63.74 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1153  ribonuclease HII  68.85 
 
 		 206 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344887  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1643  ribonuclease HII  64.06 
 
 		 209 aa  231  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1362  ribonuclease HII  65.61 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1459  ribonuclease HII  64.92 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0235521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2888  ribonuclease HII  64.4 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0614829  normal  0.459177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1464  ribonuclease HII  64.92 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0142588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1495  ribonuclease HII  65.26 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0185949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  60.54 
 
 		 193 aa  228  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2694  ribonuclease HII  64.02 
 
 		 209 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.529016  hitchhiker  0.00296162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  63.19 
 
 		 207 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  63.19 
 
 		 207 aa  227  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  57.98 
 
 		 199 aa  227  9e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  62.64 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  63.3 
 
 		 207 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2627  ribonuclease HII  62.96 
 
 		 209 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0862434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  62.64 
 
 		 207 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3267  ribonuclease HII  65.45 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2801  ribonuclease HII  63.49 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.907957 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  63.24 
 
 		 191 aa  222  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  62.77 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  60.22 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  62.16 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  56.99 
 
 		 197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  55.38 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  63.44 
 
 		 199 aa  214  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  57.59 
 
 		 196 aa  214  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  57.59 
 
 		 208 aa  214  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  58.7 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  57.22 
 
 		 202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  57.22 
 
 		 202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  56.28 
 
 		 198 aa  208  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1850  RNase HII  61.96 
 
 		 198 aa  207  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  54.97 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  57.84 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  58.89 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  55.03 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  54.55 
 
 		 236 aa  204  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  54.1 
 
 		 201 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  54.45 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  54.89 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  57.61 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  56.15 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  57.61 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2443  ribonuclease HII  55.14 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0013683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  53.61 
 
 		 217 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  54.12 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  53.61 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  53.93 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  53.93 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  53.93 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  54.21 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  52.02 
 
 		 232 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  54.5 
 
 		 249 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  57.14 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>