268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3348 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  43.79 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  37.57 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  37.57 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  34.42 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  32.69 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  31.71 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  32.8 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  32.47 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  35.03 
 
 		 194 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  27.36 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.36 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  30.84 
 
 		 623 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  27.36 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  27.36 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  27.36 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  27.36 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  27.36 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  27.36 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  26.89 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  32.31 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  30.88 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  32.02 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  31.43 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  33.78 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  37.35 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.35 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.89 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  28.39 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  29.57 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  29.57 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  32.64 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  39.04 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  28.74 
 
 		 267 aa  71.6  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  27.84 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  34.11 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  34.01 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  31.98 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.31 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  29.14 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  29.31 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  28.9 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  30.34 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  29.65 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  30.3 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  26.6 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  27.83 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  32.74 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  27.97 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  27.18 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  36.96 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  27.83 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  31.34 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  28.79 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  29.33 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  30.73 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  30.56 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  30.56 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  30.56 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  30.64 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  30.64 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.91 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  30.64 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  25.67 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  32.12 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  31.21 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  25.79 
 
 		 266 aa  62  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  30.05 
 
 		 192 aa  62  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  27.03 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  33.05 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  28.03 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  34.69 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  27.42 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  30 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  28.21 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.35 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  23.39 
 
 		 714 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  27.03 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  29.06 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  27.01 
 
 		 738 aa  58.9  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  26.49 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.66 
 
 		 746 aa  58.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  26.49 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  27.89 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  26.49 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  26.04 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  26.49 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  30.08 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.86 
 
 		 722 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  30.08 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  25.95 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  26.49 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>