More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2531 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2531  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
341 aa  694    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
327 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  28.22 
 
 
348 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.82 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  30.54 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  28.53 
 
 
349 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.11 
 
 
336 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
351 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
351 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.06 
 
 
333 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.05 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.36 
 
 
343 aa  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.39 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  29.74 
 
 
341 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
342 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
342 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
342 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
343 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  32.13 
 
 
342 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  32.37 
 
 
343 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  27.81 
 
 
336 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  29.97 
 
 
345 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  27.66 
 
 
344 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  29.1 
 
 
352 aa  124  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  31.05 
 
 
342 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  28.48 
 
 
318 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  31.88 
 
 
342 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3564  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
347 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.950821  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  30.84 
 
 
344 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  30.69 
 
 
343 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  30.69 
 
 
343 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  30.28 
 
 
345 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  31.41 
 
 
342 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  27.73 
 
 
341 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  26.78 
 
 
352 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  29.18 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  31.58 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  31.05 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  30.58 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  29.85 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  30 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  28.09 
 
 
341 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  25.53 
 
 
373 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  30.51 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  27.41 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.6 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  27.41 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  27.41 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  28.29 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  30.51 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  30.51 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  30.51 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.7 
 
 
342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  30.51 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  30.51 
 
 
341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.18 
 
 
336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  30.51 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  28.62 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  28.09 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  28.09 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  28.09 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  29.1 
 
 
341 aa  119  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  28.43 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.77 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  29.64 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  30.15 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  30.15 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.04 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  28.97 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  29.13 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  25.53 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  28.27 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  30.28 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  24.7 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  29.56 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.88 
 
 
347 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.94 
 
 
354 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.53 
 
 
373 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  28.74 
 
 
341 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  27.22 
 
 
343 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  29.56 
 
 
343 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  28.79 
 
 
343 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>