140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2114 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  65.73 
 
 
514 aa  655    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  62.26 
 
 
510 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  100 
 
 
514 aa  1058    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  51.43 
 
 
492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  48.16 
 
 
502 aa  455  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  47.3 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  46.08 
 
 
561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  49.79 
 
 
494 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  44.79 
 
 
493 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.51 
 
 
487 aa  350  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  41.88 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  42.27 
 
 
581 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.21 
 
 
524 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.21 
 
 
504 aa  326  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.56 
 
 
516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.56 
 
 
516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.43 
 
 
590 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.56 
 
 
516 aa  320  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.59 
 
 
544 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  36.94 
 
 
573 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.2 
 
 
513 aa  312  9e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.2 
 
 
513 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.01 
 
 
513 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.89 
 
 
492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.79 
 
 
513 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  34.55 
 
 
503 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  37.92 
 
 
499 aa  293  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.88 
 
 
533 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.79 
 
 
503 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.12 
 
 
514 aa  286  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.55 
 
 
517 aa  286  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.97 
 
 
490 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  37.24 
 
 
500 aa  280  6e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01964  serine carboxypeptidase  32.87 
 
 
531 aa  280  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395984  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.46 
 
 
554 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.04 
 
 
558 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  36.58 
 
 
543 aa  270  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.93 
 
 
558 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.88 
 
 
558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.88 
 
 
558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.88 
 
 
553 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  33.82 
 
 
517 aa  264  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.03 
 
 
558 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  35.95 
 
 
551 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  34.92 
 
 
554 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.09 
 
 
558 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.22 
 
 
558 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  35.12 
 
 
554 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  35.12 
 
 
554 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  35.12 
 
 
554 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  35.12 
 
 
554 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  35.12 
 
 
554 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  35.12 
 
 
554 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  36.07 
 
 
536 aa  256  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.66 
 
 
611 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.66 
 
 
611 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.5 
 
 
614 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.31 
 
 
613 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0790  carboxypeptidase S1  35.29 
 
 
481 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.66 
 
 
611 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00179  serine carboxypeptidase  34.12 
 
 
490 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  33.46 
 
 
611 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.06 
 
 
521 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  33.33 
 
 
615 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  33.33 
 
 
615 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  33.13 
 
 
613 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  33.33 
 
 
615 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  33.33 
 
 
615 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  33.33 
 
 
619 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  33.33 
 
 
615 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  33.33 
 
 
615 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.91 
 
 
536 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.99 
 
 
514 aa  239  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  34.91 
 
 
536 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.7 
 
 
536 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.7 
 
 
536 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.64 
 
 
522 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5084  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.9 
 
 
500 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.189262 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1173  serine-type carboxypeptidase family protein  32.61 
 
 
588 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3491  serine-type carboxypeptidase family protein  32.41 
 
 
593 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0412  serine-type carboxypeptidase family protein  32.41 
 
 
544 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.614642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1272  serine-type carboxypeptidase family protein  32.41 
 
 
544 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3454  serine carboxypeptidase family protein  32.41 
 
 
544 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3492  serine carboxypeptidase family protein  32.41 
 
 
544 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3293  serine-type carboxypeptidase family protein  32.41 
 
 
544 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2492  serine-type carboxypeptidase family protein  32.41 
 
 
571 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.91 
 
 
536 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.5 
 
 
535 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0516  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.7 
 
 
536 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371742  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1444  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.37 
 
 
498 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00886012  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1968  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.54 
 
 
511 aa  226  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.14 
 
 
508 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.854374  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1122  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.53 
 
 
522 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1336  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.91 
 
 
533 aa  224  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4619  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.91 
 
 
511 aa  223  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2967  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.75 
 
 
517 aa  223  9e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.53 
 
 
573 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4351  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.3 
 
 
510 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3109  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32 
 
 
530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.54 
 
 
573 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>