More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1580 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 137 aa  283  7e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  86.86 
 
 		 137 aa  254  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  84.67 
 
 		 137 aa  250  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  83.94 
 
 		 137 aa  241  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  83.94 
 
 		 137 aa  240  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  76.64 
 
 		 138 aa  230  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  72.99 
 
 		 137 aa  216  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  67.15 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  67.15 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  63.97 
 
 		 139 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  64.23 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1538  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2894  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  62.77 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0894  Nucleoside-diphosphate kinase  58.09 
 
 		 139 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150148  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  58.09 
 
 		 139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 139 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  62.5 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  58.39 
 
 		 139 aa  177  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1127  nucleoside diphosphate kinase  62.04 
 
 		 140 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2594  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  58.39 
 
 		 138 aa  176  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2023  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1822  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  59.85 
 
 		 143 aa  173  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  60.74 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1746  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2901  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  56.93 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 141 aa  170  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 141 aa  170  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  62.04 
 
 		 143 aa  170  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 		 140 aa  169  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  60.9 
 
 		 141 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2328  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  58.52 
 
 		 146 aa  169  9e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  59.26 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  58.82 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 140 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 		 141 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  56.93 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  58.39 
 
 		 140 aa  168  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  60 
 
 		 140 aa  168  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  59.56 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 141 aa  166  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  59.56 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  56.62 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  57.35 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1079  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4361  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  54.41 
 
 		 141 aa  164  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  57.78 
 
 		 140 aa  164  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1224  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 140 aa  164  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  55.15 
 
 		 141 aa  164  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  54.74 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 		 141 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  56.62 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 143 aa  163  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  57.35 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  56.62 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>