36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1507 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  745    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  34.08 
 
 		 464 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  33 
 
 		 681 aa  93.2  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  33 
 
 		 681 aa  93.2  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  32.51 
 
 		 590 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  31.56 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  33.01 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  33 
 
 		 678 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  30.53 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2479  hypothetical protein  32.4 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.285758 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  27.97 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  34.3 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  31.25 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  28.99 
 
 		 679 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  31.84 
 
 		 759 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  32.07 
 
 		 717 aa  76.6  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  28.97 
 
 		 647 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  33.68 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  32.64 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  30.1 
 
 		 728 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3911  hypothetical protein  28.33 
 
 		 587 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  29 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  32.3 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6524  hypothetical protein  27.64 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  26.18 
 
 		 756 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  30.05 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2616  AAA ATPase  29.03 
 
 		 674 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  30.05 
 
 		 569 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  29.19 
 
 		 292 aa  53.5  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  28.18 
 
 		 667 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  28.11 
 
 		 292 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  26.84 
 
 		 741 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  23.84 
 
 		 642 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  27.51 
 
 		 654 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  25.34 
 
 		 796 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  29.37 
 
 		 248 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>