More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2939 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  70.55 
 
 		 696 aa  1011    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.04 
 
 		 695 aa  795    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 696 aa  1418    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0484  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.22 
 
 		 693 aa  698    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000150879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0467  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.79 
 
 		 693 aa  704    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.285916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.47 
 
 		 698 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 		 707 aa  445  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  41.33 
 
 		 528 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4367  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.34 
 
 		 524 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3480  methyl-accepting chemotaxis protein  36.3 
 
 		 533 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0820031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 		 538 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3326  chemotaxis sensory transducer  36.12 
 
 		 534 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3261  chemotaxis sensory transducer  35.39 
 
 		 534 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 		 602 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1155  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.86 
 
 		 523 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4857  methyl-accepting chemotaxis protein  37.42 
 
 		 535 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3399  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.19 
 
 		 523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 		 522 aa  275  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55750  putative chemotaxis transducer  41.76 
 
 		 538 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.19 
 
 		 523 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2241  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 		 598 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2475  methyl-accepting chemotaxis protein  32.89 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0390427  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.53 
 
 		 598 aa  267  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.08 
 
 		 522 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.08 
 
 		 522 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.08 
 
 		 522 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1290  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.86 
 
 		 522 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03575  methyl-accepting chemotaxis protein  37.14 
 
 		 525 aa  263  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.02 
 
 		 514 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 		 573 aa  257  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3042  methyl-accepting chemotaxis protein  34.67 
 
 		 527 aa  257  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.26 
 
 		 546 aa  254  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4961  methyl-accepting chemotaxis protein  35.35 
 
 		 527 aa  244  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.6 
 
 		 505 aa  243  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1985  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  30.12 
 
 		 715 aa  241  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.06 
 
 		 534 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.695651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5132  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 468 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 476 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 468 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 		 484 aa  211  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 495 aa  210  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2227  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.2 
 
 		 481 aa  210  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.237535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.04 
 
 		 674 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.92 
 
 		 544 aa  209  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 470 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.09 
 
 		 468 aa  207  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.69 
 
 		 546 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 		 570 aa  203  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  38.69 
 
 		 549 aa  203  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 		 545 aa  203  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 		 549 aa  203  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.28 
 
 		 470 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856427  normal  0.10181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.04 
 
 		 700 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.07 
 
 		 470 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.23 
 
 		 533 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 546 aa  201  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 541 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 		 547 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 		 543 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249155  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 		 569 aa  196  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.85 
 
 		 550 aa  196  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 700 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.36 
 
 		 525 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.603344  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.42 
 
 		 454 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00717627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.16 
 
 		 547 aa  196  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.47 
 
 		 423 aa  195  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 661 aa  195  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.23 
 
 		 542 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 		 540 aa  193  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 		 542 aa  193  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  39.63 
 
 		 549 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 		 547 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  36.12 
 
 		 539 aa  191  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.56 
 
 		 475 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18628  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  38.89 
 
 		 533 aa  191  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.61 
 
 		 557 aa  190  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3805  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 		 422 aa  190  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000721713  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.2 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 		 666 aa  189  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  41.1 
 
 		 541 aa  188  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  39.1 
 
 		 392 aa  188  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 		 658 aa  188  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1014  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.9 
 
 		 482 aa  188  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 		 544 aa  187  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  37.19 
 
 		 544 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 716 aa  184  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 		 543 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 543 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.64 
 
 		 632 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 		 713 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.03 
 
 		 565 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 487 aa  182  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>