More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3084 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  71.5 
 
 		 202 aa  304  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  64 
 
 		 200 aa  279  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  59.2 
 
 		 201 aa  262  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  58.5 
 
 		 217 aa  249  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  57.79 
 
 		 213 aa  249  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  51.5 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  50.5 
 
 		 198 aa  207  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  39.44 
 
 		 591 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  36.7 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  37.44 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  39.68 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  38.59 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  37.91 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.05 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.54 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 402 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  36.91 
 
 		 155 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 411 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 440 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 378 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  31.47 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.64 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 412 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.54 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.12 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.12 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.5 
 
 		 427 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.67 
 
 		 369 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.81 
 
 		 382 aa  98.2  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 226 aa  98.2  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  34.33 
 
 		 452 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.23 
 
 		 378 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 225 aa  94.4  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.77 
 
 		 378 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 391 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.65 
 
 		 356 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 237 aa  90.5  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  31.37 
 
 		 383 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.5 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 224 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.5 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 240 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.55 
 
 		 442 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.18 
 
 		 442 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.5 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  29.95 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.56 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 448 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 448 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  29.02 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.02 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  33.76 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.81 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 449 aa  85.5  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.46 
 
 		 442 aa  85.5  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  36.2 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.23 
 
 		 442 aa  85.1  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 218 aa  84.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  28.4 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 230 aa  84.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 		 203 aa  84.7  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 366 aa  84.7  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.75 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>