39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1429 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1429  integrase family protein  100 
 
 		 578 aa  1194    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  32.28 
 
 		 434 aa  91.3  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  23.08 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  22.33 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  21.16 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  25.07 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  25.14 
 
 		 649 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  21.8 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  25 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  24.27 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  22.72 
 
 		 588 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  22.2 
 
 		 602 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  21.71 
 
 		 535 aa  54.7  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  26.44 
 
 		 605 aa  53.9  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  22.5 
 
 		 651 aa  53.5  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  28.3 
 
 		 602 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  23.55 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  22.8 
 
 		 452 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  25.3 
 
 		 388 aa  51.6  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  23.91 
 
 		 509 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  22.8 
 
 		 412 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  22.96 
 
 		 508 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  22.96 
 
 		 508 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  24.54 
 
 		 563 aa  50.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  25.77 
 
 		 581 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  23.21 
 
 		 646 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  22.43 
 
 		 531 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  22.76 
 
 		 538 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  26.26 
 
 		 548 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  24.68 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  25.13 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  20.56 
 
 		 529 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  22.26 
 
 		 587 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  22.32 
 
 		 662 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  21.5 
 
 		 618 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  24.25 
 
 		 687 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  20.81 
 
 		 439 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  23.74 
 
 		 292 aa  43.9  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  22.01 
 
 		 593 aa  43.5  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>