More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3447 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3447  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 266 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.652082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  38.33 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1202  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1508  cell cycle transcriptional regulator ctrA  38.38 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2621  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75303  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1399  two component transcriptional regulator  39.2 
 
 		 239 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1279  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461363  normal  0.257738 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1903  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0732  cell cycle transcriptional regulator  34.87 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2505  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791438  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0303  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 233 aa  135  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5319  cell cycle transcriptional regulator CtrA  37.37 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2529  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1569  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0784  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1830  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3488  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.487721  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0574  two component transcriptional regulator  37.43 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.821306  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0563  two component transcriptional regulator  36.87 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.621979  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0824  response regulator receiver  35.68 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4854  two component transcriptional regulator  37.88 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1599  cell cycle transcriptional regulator CtrA  36.56 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3912  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 233 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4233  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 233 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0736222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3079  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 233 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1542  cell cycle transcriptional regulator CtrA  36.56 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2605  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 233 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3672  winged helix family two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 233 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2213  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  37 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3336  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 233 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.523001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1822  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 233 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.077619  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3622  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0114155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0747  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  0.934966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3946  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26309  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1026  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 231 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0525  transcriptional regulatory protein  36.56 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369528  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3371  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.442318  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5573  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3527  two component response regulator  37 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6127  two component transcriptional regulator  38.34 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2174  two component transcriptional regulator  33.47 
 
 		 235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6533  cell cycle transcriptional regulator CtrA  36.12 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0344  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1019  cell cycle transcriptional regulator CtrA  37.19 
 
 		 233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.736916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  35.32 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  32.18 
 
 		 265 aa  118  9e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  33.05 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  30.88 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 221 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  37.88 
 
 		 225 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1198  two component transcriptional regulator  31.16 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  32.04 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  31.79 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  31.79 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  32.16 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  31.98 
 
 		 222 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  31.49 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  31.49 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49180  two-component response regulator PhoP  31.5 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831037 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  31.49 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  31.49 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4200  two-component response regulator PhoP  31 
 
 		 225 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4230  two component transcriptional regulator  30.15 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  32.39 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 219 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 219 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1186  winged helix family two component transcriptional regulator  30.15 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  30.65 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.05 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1216  two component transcriptional regulator  30.15 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0234  DNA-binding response regulator  30.6 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  30.89 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.44 
 
 		 224 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 219 aa  99  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1408  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  99  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.3 
 
 		 224 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 226 aa  98.6  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2486  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  31.66 
 
 		 224 aa  98.6  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  32.74 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.44 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3454  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.84 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1810  DNA-binding response regulator  28.36 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0562957  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.41 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  30.84 
 
 		 231 aa  96.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1679  transcriptional regulatory protein PhoP, putative  30.65 
 
 		 225 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3709  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.65 
 
 		 225 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2624  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.11 
 
 		 223 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1791  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 224 aa  96.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.506547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 227 aa  96.3  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1866  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  32.78 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>