More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1312 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1312  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
140 aa  278  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0997664  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  52.13 
 
 
134 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1682  ATP synthase F1, epsilon subunit  48.86 
 
 
137 aa  102  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.04 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.8 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.7 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.24 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.5 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.4 
 
 
133 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.4 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.68 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.14 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.97 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.5 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.33 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.95 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.62 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.82 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.82 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.9 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.79 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.64 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.27 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12040  ATP synthase, F1 epsilon subunit  33.93 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.7 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.27 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.24 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.14 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2300  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.08 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.349396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.14 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.52 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.66 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.77 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.52 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.9 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0975  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.93 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.7 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.46 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.808616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.93 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.16 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  39 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.25 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.46 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.75 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.83 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.83 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.83 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.83 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.96 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.77 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.83 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.83 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.61 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3710  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.41 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2085  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.11 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3656  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.41 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.04 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2200  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  35.23 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.94 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.46 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.36 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.48 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.74 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1672  ATP synthase epsilon subunit  34.29 
 
 
135 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.485979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.83 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.03 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.37 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0516  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5412  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.43 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201274 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.53 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.43 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.43 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4606  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.09 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.56 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4603  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.83 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359837  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4469  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.83 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0365154  normal  0.135413 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.64 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10032  ATP synthase delta chain, mitochondrial precursor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03100)  30.3 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0262441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.41 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.33 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.72 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.8 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.72 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.41 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.38 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>