52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1158 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  100 
 
 
409 aa  819    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  69.03 
 
 
379 aa  511  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  69.25 
 
 
386 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  47.65 
 
 
383 aa  306  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  43.27 
 
 
394 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  42.77 
 
 
394 aa  269  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  40.86 
 
 
383 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  40.56 
 
 
415 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  42.86 
 
 
388 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  42.57 
 
 
388 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  43.19 
 
 
388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  43.22 
 
 
386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  33 
 
 
389 aa  180  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  35.45 
 
 
377 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  32.62 
 
 
343 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  34.64 
 
 
390 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  34.95 
 
 
401 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  31.25 
 
 
362 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  34.69 
 
 
401 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  33.9 
 
 
397 aa  156  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  31.07 
 
 
342 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  33.81 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  32.36 
 
 
403 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  30.85 
 
 
421 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  33.23 
 
 
376 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  35.08 
 
 
400 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  32.11 
 
 
394 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  30.42 
 
 
386 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  33.65 
 
 
366 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  28.9 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  31.55 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  28.9 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.12 
 
 
545 aa  133  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  32.01 
 
 
396 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  29.97 
 
 
358 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  31.45 
 
 
365 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  28.7 
 
 
380 aa  123  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  31.89 
 
 
383 aa  123  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  30.81 
 
 
402 aa  123  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  29.95 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  30.34 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  30.23 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  31.77 
 
 
343 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  31.61 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  28.31 
 
 
352 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  31.41 
 
 
279 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  29.65 
 
 
386 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1686  hypothetical protein  34.43 
 
 
102 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02040  gluconolactonase  28.47 
 
 
298 aa  44.3  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  31.18 
 
 
308 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.94 
 
 
304 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.85 
 
 
296 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>