48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0288 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  53.07 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  35.9 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.91 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.05 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.04 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  31.76 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.22 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.94 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.02 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  33.77 
 
 		 232 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.79 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  33.48 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.54 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.06 
 
 		 250 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  33.63 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.48 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.82 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  32.74 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.05 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.28 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.28 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.62 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  31.65 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.43 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.65 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.43 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  24.31 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.05 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.29 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.65 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.19 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.57 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  23.74 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.34 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.25 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.06 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  33.64 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  28.26 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.65 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.6 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  34 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.14 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  26.47 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  25.55 
 
 		 321 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.95 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.97 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.46 
 
 		 318 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>