100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1502 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1502  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2819  virulence factor Mce family protein  32.97 
 
 
422 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.906597  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03770  virulence factor Mce family protein  30.48 
 
 
420 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0708  virulence factor Mce family protein  28.96 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0372566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4165  virulence factor Mce family protein  27.73 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4165  virulence factor Mce family protein  27.83 
 
 
484 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1173  virulence factor Mce family protein  26.51 
 
 
432 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2106  virulence factor Mce family protein  28.57 
 
 
486 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.583314  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1632  virulence factor Mce family protein  32.6 
 
 
484 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175029  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1659  virulence factor MCE-like protein  32.6 
 
 
484 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0518  virulence factor Mce family protein  32.6 
 
 
484 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.608059  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1683  virulence factor Mce family protein  32.6 
 
 
484 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0647  virulence factor Mce family protein  32.6 
 
 
484 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4533  virulence factor Mce family protein  26.32 
 
 
504 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0456406  normal  0.287629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1529  virulence factor MCE-like protein  28 
 
 
479 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1552  virulence factor Mce family protein  28 
 
 
479 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977582  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3679  virulence factor Mce family protein  25.59 
 
 
564 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2513  virulence factor Mce family protein  26.54 
 
 
564 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3666  virulence factor MCE-like protein  25.59 
 
 
564 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3739  virulence factor Mce family protein  25.59 
 
 
564 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3977  virulence factor Mce family protein  28.44 
 
 
479 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240888  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  26.87 
 
 
355 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0927  virulence factor Mce family protein  29.41 
 
 
495 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903302  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4145  virulence factor Mce family protein  26.83 
 
 
561 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.903302  normal  0.559384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4599  virulence factor Mce family protein  28.99 
 
 
499 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.376755  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1240  Mammalian cell entry related domain protein  26.7 
 
 
320 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3945  virulence factor Mce family protein  25.4 
 
 
476 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1506  virulence factor Mce family protein  24.39 
 
 
339 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3828  virulence factor Mce family protein  25.95 
 
 
352 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12002  MCE-family protein mce3F  26.09 
 
 
437 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000281764  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10605  MCE family lipoprotein LprL  25.94 
 
 
402 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.961449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09310  virulence factor Mce family protein  27.87 
 
 
394 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.91288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4394  virulence factor Mce family protein  29.51 
 
 
483 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0368  virulence factor Mce family protein  26.61 
 
 
481 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0005  virulence factor Mce family protein  26.89 
 
 
416 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3485  virulence factor Mce family protein  26.82 
 
 
415 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4183  virulence factor Mce family protein  25.41 
 
 
482 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.791662  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0840  hypothetical protein  26.01 
 
 
317 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0706  virulence factor Mce family protein  25.59 
 
 
520 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.900705  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4175  Mammalian cell entry related domain protein  28.5 
 
 
370 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5197  virulence factor Mce family protein  23.62 
 
 
564 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0737049  normal  0.144071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0113  virulence factor Mce family protein  25.53 
 
 
519 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0123  virulence factor MCE-like protein  25.11 
 
 
519 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0132  virulence factor Mce family protein  25.11 
 
 
519 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.208767  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0962  virulence factor Mce family protein  32.08 
 
 
372 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2981  virulence factor Mce family protein  27.85 
 
 
390 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1561  virulence factor Mce family protein  26.32 
 
 
565 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4176  Mammalian cell entry related domain protein  27.21 
 
 
345 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0271  virulence factor Mce family protein  24.49 
 
 
512 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10606  MCE-family protein mce2F  27.22 
 
 
516 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.466214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0280  virulence factor MCE-like protein  24.49 
 
 
512 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0290  virulence factor Mce family protein  24.49 
 
 
512 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2244  virulence factor Mce family protein  23.98 
 
 
356 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13531  MCE-family protein mce4C  24.77 
 
 
357 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1135  virulence factor Mce family protein  27.07 
 
 
413 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  27.7 
 
 
316 aa  48.5  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13528  MCE-family protein mce4F  25.63 
 
 
564 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000487906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4177  Mammalian cell entry related domain protein  27.68 
 
 
356 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0707  virulence factor Mce family protein  24.46 
 
 
381 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0518  virulence factor Mce family protein  25.16 
 
 
337 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03760  virulence factor Mce family protein  21.62 
 
 
398 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.704534  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0709  virulence factor Mce family protein  25.65 
 
 
523 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.936925  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0009  virulence factor Mce family protein  30.77 
 
 
351 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629178  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4700  virulence factor Mce family protein  23.91 
 
 
584 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0707  virulence factor Mce family protein  25.15 
 
 
472 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.953173  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4612  virulence factor MCE-like protein  23.91 
 
 
584 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  27.05 
 
 
332 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0112  virulence factor Mce family protein  24.62 
 
 
382 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0960  virulence factor Mce family protein  28.57 
 
 
351 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0131  virulence factor Mce family protein  24.62 
 
 
382 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307486  normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0122  virulence factor MCE-like protein  24.62 
 
 
382 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  21.27 
 
 
316 aa  45.1  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4995  virulence factor Mce family protein  24.74 
 
 
580 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.771933  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4998  virulence factor Mce family protein  24.54 
 
 
352 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0139  virulence factor Mce family protein  26.98 
 
 
520 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  25.65 
 
 
360 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1627  virulence factor Mce family protein  21.53 
 
 
509 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03151  putative ABC transporter  25.53 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1219  Mammalian cell entry related domain protein  23.12 
 
 
326 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0367  virulence factor Mce family protein  25.16 
 
 
378 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0838  hypothetical protein  23.27 
 
 
364 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0964  hypothetical protein  25.29 
 
 
416 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10175  MCE-family protein mce1F  24.57 
 
 
515 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  21.62 
 
 
347 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  23.56 
 
 
339 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
476 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  27.6 
 
 
360 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3824  virulence factor Mce family protein  30.4 
 
 
358 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  24.32 
 
 
316 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0517  virulence factor Mce family protein  24.24 
 
 
355 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  30.84 
 
 
152 aa  43.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09320  virulence factor Mce family protein  24.5 
 
 
359 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.906316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  22.66 
 
 
321 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1504  virulence factor Mce family protein  25 
 
 
395 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4571  Mammalian cell entry related domain protein  34.92 
 
 
468 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  22.5 
 
 
337 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  27.5 
 
 
360 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0874  hypothetical protein  32.99 
 
 
158 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0905  hypothetical protein  32.99 
 
 
158 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13532  MCE-family protein mce4B  23.4 
 
 
350 aa  41.6  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>