173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0586 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  50.74 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  49.52 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  49.5 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.44 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.34 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  43.06 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  44.6 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  45.41 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  50.88 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  40.91 
 
 		 449 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  39.45 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.41 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.33 
 
 		 256 aa  111  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.93 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  34.43 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  30 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  33.02 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  35.19 
 
 		 417 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3968  hypothetical protein  41.04 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2387  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  45.68 
 
 		 99 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2248  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.11 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00853902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2511  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.73 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000204873  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31220  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.26 
 
 		 96 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12116  normal  0.529511 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0727  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.04 
 
 		 101 aa  62  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.856744  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2038  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.84 
 
 		 97 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1232  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.9 
 
 		 93 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0395  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  45.59 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.194663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  36 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1636  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.36 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.113224  normal  0.269211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.38 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1724  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.35 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194781 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.78 
 
 		 395 aa  58.9  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40 
 
 		 93 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3381  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.86 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0604341  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1547  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  33.64 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4044  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.55 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4119  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.55 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.619086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4273  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.55 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  40.82 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  28.99 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22650  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.97 
 
 		 103 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  29.86 
 
 		 149 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 335 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  30.99 
 
 		 144 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0680  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.62 
 
 		 120 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0707  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.62 
 
 		 131 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.289633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  32.26 
 
 		 127 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.32 
 
 		 94 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  35.85 
 
 		 127 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1245  4A-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  36 
 
 		 82 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.361508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4347  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.1 
 
 		 93 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.821265  normal  0.581747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  34.23 
 
 		 120 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3244  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 		 93 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  34.51 
 
 		 113 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  33.93 
 
 		 127 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1218  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 		 93 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1250  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40 
 
 		 99 aa  52.4  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2199  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.06 
 
 		 94 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7703  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.67 
 
 		 96 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  32.54 
 
 		 129 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  34.26 
 
 		 119 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  28.37 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0180  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.59 
 
 		 133 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.17 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2684  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.37 
 
 		 89 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.819966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5747  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.74 
 
 		 125 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.674967  hitchhiker  0.0082739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0408  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.65 
 
 		 100 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0568547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  30.2 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1815  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.62 
 
 		 104 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4549  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.39 
 
 		 93 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164761  normal  0.300182 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  39.73 
 
 		 141 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1071  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  51.06 
 
 		 100 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0179727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  28.17 
 
 		 144 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  28.37 
 
 		 144 aa  49.3  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  30 
 
 		 117 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11184  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.72 
 
 		 94 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000707636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  31.47 
 
 		 145 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2557  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.71 
 
 		 92 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  32.43 
 
 		 116 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  32.74 
 
 		 123 aa  48.5  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0874  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.54 
 
 		 124 aa  48.5  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000104315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0898  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  45.28 
 
 		 92 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 		 136 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  38.1 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  32.43 
 
 		 116 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  32.43 
 
 		 116 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  34.23 
 
 		 131 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  29.58 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1826  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.27 
 
 		 104 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3629  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.11 
 
 		 101 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  32.14 
 
 		 127 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 		 136 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  31.48 
 
 		 119 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1412  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.11 
 
 		 104 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0351237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  35.19 
 
 		 116 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8574  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.53 
 
 		 117 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224719  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  30.63 
 
 		 128 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>