More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0540 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0540  Resolvase domain protein  100 
 
 		 190 aa  360  7.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  41.45 
 
 		 206 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  40.88 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  34.05 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  34.05 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  34.05 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  45.1 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  42.22 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  36.61 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  38.54 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  38.54 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  38.54 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  38.42 
 
 		 208 aa  98.2  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  37.84 
 
 		 182 aa  98.2  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  34.02 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.76 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.77 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  34.21 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  35.48 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.07 
 
 		 185 aa  94.4  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  38.54 
 
 		 210 aa  94.4  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  38.22 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  34.81 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  42.14 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  38.54 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  44 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  37.1 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.92 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  44 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  42.28 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  35.33 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  42.28 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  42.28 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.07 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 		 194 aa  91.7  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  35.45 
 
 		 206 aa  91.3  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  39.24 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  39.24 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  39.24 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  37.28 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  35.16 
 
 		 183 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  35.16 
 
 		 183 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.26 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  33.7 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  36.61 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  36.61 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  34.05 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  31.75 
 
 		 192 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  35.94 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  36.41 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  35.94 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  32.8 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.05 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  34.32 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.67 
 
 		 184 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  33.15 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  41.33 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  32.42 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  32.42 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  31.91 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  38.31 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  31.22 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.42 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.43 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2284  Resolvase domain protein  36.17 
 
 		 190 aa  84.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.41 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  32.97 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  36.6 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  37.86 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  34.62 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  36.67 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  38.54 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  31.49 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  35 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  31.52 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  32.67 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  35.96 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2332  resolvase domain-containing protein  35.2 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>