More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2053 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  98.78 
 
 		 328 aa  675    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  100 
 
 		 328 aa  681    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  68.81 
 
 		 329 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  66.67 
 
 		 329 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  66.67 
 
 		 329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  64.33 
 
 		 328 aa  448  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  56.6 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  54.74 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  49.18 
 
 		 361 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  51.13 
 
 		 368 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  45.25 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  46.84 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  46.54 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  46.56 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  44.97 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  47.81 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  44.03 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  47.19 
 
 		 361 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  48.38 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  45.29 
 
 		 388 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  44.98 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  46.5 
 
 		 370 aa  279  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  44.13 
 
 		 320 aa  276  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  42.14 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  41.19 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  43.98 
 
 		 368 aa  271  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  43.67 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  43.93 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  46.42 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  41.72 
 
 		 338 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  40.25 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  42.37 
 
 		 332 aa  255  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  40.59 
 
 		 319 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  39.38 
 
 		 332 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  38.99 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  41.78 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  39.06 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  38.44 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  38.44 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  38.44 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  38.44 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  38.44 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  38.44 
 
 		 332 aa  241  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  38.12 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  38.25 
 
 		 370 aa  240  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  36.96 
 
 		 321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  37.81 
 
 		 332 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  39.94 
 
 		 375 aa  238  9e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  38.12 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  38.41 
 
 		 333 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  39.06 
 
 		 321 aa  235  8e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  34.67 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  37.22 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  36.45 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  37.22 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  38.32 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  41.39 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  39.88 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  36.39 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  42.96 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  39.13 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  40.4 
 
 		 316 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.87 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  39.34 
 
 		 411 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  40.13 
 
 		 339 aa  225  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  39.23 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  41.9 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  36.2 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  37.3 
 
 		 330 aa  218  8.999999999999998e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  40.19 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  41.25 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  38.29 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  38.29 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  37.5 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  34.27 
 
 		 326 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  35.65 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  36.86 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  35.09 
 
 		 412 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  38.56 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  36.77 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  33.88 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  36.45 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  36.02 
 
 		 331 aa  202  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  35.83 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  36.74 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  38.87 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  35.17 
 
 		 352 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  37.59 
 
 		 351 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  37.25 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  37.8 
 
 		 344 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  36.13 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0176  biotin synthase  40.58 
 
 		 275 aa  197  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0644225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  36.46 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  34.15 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  36.46 
 
 		 322 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  36.46 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  36.46 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  36.46 
 
 		 339 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  33.84 
 
 		 331 aa  195  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  36.46 
 
 		 339 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>