More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0442 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0442  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 326 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05450  putative hydrolase signal peptide protein  59.82 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2950  putative hydrolase signal peptide protein  56.07 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0207  alpha/beta hydrolase fold  49.07 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 263 aa  136  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  27.74 
 
 		 263 aa  96.7  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 266 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 266 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 277 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  27.67 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 266 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49119  predicted protein  23.83 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00923663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 267 aa  86.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1280  alpha/beta fold family hydrolase  28.82 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  32.33 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 276 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  23.27 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  24.16 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  23.76 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  24.65 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  23.63 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2340  alpha/beta hydrolase fold protein  23.49 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304553  normal  0.102519 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  23.32 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86812  predicted protein  21.66 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 291 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  27.34 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  21.33 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  24.38 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  23.4 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  23.21 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  24.7 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  21.33 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  22.54 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2266  alpha/beta hydrolase fold  22.98 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  24.39 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  24.03 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  21.62 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  21.11 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.33 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  21.59 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  22.78 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  22.37 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  24.63 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  21.55 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  22.37 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  25.33 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  24.46 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  20.73 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  19.49 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  20.28 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 271 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  24.03 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  20.85 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  22.7 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  30.3 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  22.22 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  23.33 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  22.65 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>