More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0293 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  80.39 
 
 		 204 aa  285  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  48.73 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.48 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  45.18 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.88 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  44.61 
 
 		 194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  44.67 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  41.95 
 
 		 199 aa  148  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.93 
 
 		 187 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.18 
 
 		 188 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  45.65 
 
 		 180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.9 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.56 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0589  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 		 179 aa  121  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.22 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.58 
 
 		 190 aa  118  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.18 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.92 
 
 		 172 aa  111  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  42.76 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  49.04 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  49.04 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  45.54 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  48.11 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0751  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.17 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000145376  normal  0.0872971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  49.06 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.36 
 
 		 172 aa  106  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.64 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  44.44 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  49.5 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.62 
 
 		 181 aa  104  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.14 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0857  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.23 
 
 		 155 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000523751  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.71 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  46.23 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.66 
 
 		 167 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  41.32 
 
 		 177 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.66 
 
 		 163 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  44.66 
 
 		 163 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 163 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.66 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.95 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2159  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.36 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109799  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.69 
 
 		 163 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  44.76 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.46 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.03 
 
 		 185 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.4 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2228  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  35.76 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0728  OmpA domain-containing protein  38.46 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0826309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0748  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.81 
 
 		 153 aa  99  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000605399  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  46.46 
 
 		 175 aa  98.2  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01565  outer membrane protein P6  38.3 
 
 		 148 aa  97.8  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.67 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  46.67 
 
 		 167 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0950  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.14 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.660653  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1069  outer membrane protein P6 precursor  43.14 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.427526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3482  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.784899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0756  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.853822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3418  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1528  OmpA domain-containing protein  47 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000113524  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3337  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.28 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.477382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 162 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0437517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0591  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.28 
 
 		 241 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2160  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.28 
 
 		 157 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000805861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0225  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.28 
 
 		 154 aa  95.9  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000120265  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  46.67 
 
 		 165 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.51 
 
 		 169 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.51 
 
 		 169 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  41.75 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.95 
 
 		 172 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  41.75 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  43.59 
 
 		 170 aa  95.9  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.45 
 
 		 176 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0752  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.06 
 
 		 169 aa  95.5  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000800754  normal  0.153168 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 184 aa  95.1  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2563  peptidoglycan-associated lipoprotein  46 
 
 		 179 aa  95.1  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  41.75 
 
 		 170 aa  95.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.55 
 
 		 163 aa  94.7  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2085  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.46 
 
 		 178 aa  94.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000014342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0860  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 152 aa  94.7  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.128552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 175 aa  94.7  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  45.71 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  47 
 
 		 177 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  32.52 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.71 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.57 
 
 		 169 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  42.28 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2367  OmpA/MotB domain-containing protein  47 
 
 		 178 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000270429  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2439  OmpA/MotB domain-containing protein  47 
 
 		 178 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  normal  0.228998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 169 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2530  OmpA/MotB domain-containing protein  47 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000768197  normal  0.037684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>