More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2774 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  100 
 
 
233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  51.07 
 
 
232 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  49.36 
 
 
234 aa  228  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  50.21 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  50.21 
 
 
232 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  50.69 
 
 
230 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  53.46 
 
 
230 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  51.28 
 
 
250 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1002  ABC transporter related  51.83 
 
 
231 aa  221  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3496  ABC transporter-related protein  52.49 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124026  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.21 
 
 
230 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 
237 aa  218  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.21 
 
 
230 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.89 
 
 
230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  48.73 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.93 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  47.68 
 
 
232 aa  215  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2997  ABC transporter related  51.71 
 
 
232 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  47.21 
 
 
230 aa  214  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.78 
 
 
230 aa  214  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1023  ABC transporter related  51.07 
 
 
231 aa  214  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.35 
 
 
230 aa  214  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1957  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
231 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  48.94 
 
 
232 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  46.35 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.23 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0125  ABC transporter related  48.93 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  50.46 
 
 
232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.89 
 
 
230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 
232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  46.78 
 
 
230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  49.77 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  47.44 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.23 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  46.35 
 
 
232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.31 
 
 
232 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.46 
 
 
232 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  50.69 
 
 
230 aa  211  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  44.64 
 
 
230 aa  211  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.29 
 
 
233 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.35 
 
 
229 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  48.85 
 
 
232 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.92 
 
 
232 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.92 
 
 
230 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.49 
 
 
230 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.46 
 
 
232 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 
229 aa  209  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0230  response regulator receiver domain-containing protein  45.92 
 
 
231 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562964  normal  0.557088 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.35 
 
 
230 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  46.81 
 
 
235 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  46.35 
 
 
229 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  46.35 
 
 
229 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
230 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.06 
 
 
230 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  47.21 
 
 
229 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.92 
 
 
232 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
230 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  45.92 
 
 
229 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
230 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29701  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  51.71 
 
 
255 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.92 
 
 
232 aa  208  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
230 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
230 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
230 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2246  ATPase  50.21 
 
 
236 aa  206  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1336  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 
252 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.784169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
229 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  49.08 
 
 
232 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  44.64 
 
 
230 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  44.64 
 
 
230 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.64 
 
 
230 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.92 
 
 
248 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 
231 aa  204  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1044  ATPase  50.85 
 
 
235 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19151  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  50.85 
 
 
235 aa  203  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.92 
 
 
248 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.12 
 
 
254 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1707  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.49 
 
 
229 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00153599  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3141  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.78 
 
 
233 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.06 
 
 
230 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  48.17 
 
 
232 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.21 
 
 
235 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1670  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.62 
 
 
231 aa  201  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.92 
 
 
250 aa  201  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  44.64 
 
 
230 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00885  putative branched-chain amino acid transport protein (ABC superfamily, ATP_bind)  44.64 
 
 
231 aa  201  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2003  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.32 
 
 
237 aa  201  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0805  ABC transporter related  47.91 
 
 
239 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  47.44 
 
 
231 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1593  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.64 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2699  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  46.78 
 
 
231 aa  197  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.834948  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0297  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.14 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  49.53 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.92 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  46.35 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0224  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.06 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1941  ABC transporter related  50.68 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174596  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0825  ATPase  47.68 
 
 
236 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.49 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>