More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0779 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  100 
 
 
372 aa  728    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  81.18 
 
 
372 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  56.06 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  56.06 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  56.06 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  56.06 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  56.91 
 
 
365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  56.06 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  56.06 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  54.59 
 
 
372 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  56.63 
 
 
365 aa  401  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  55.8 
 
 
372 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  55.8 
 
 
372 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  36.04 
 
 
370 aa  199  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  33.43 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  31.21 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  32.84 
 
 
362 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  29.51 
 
 
383 aa  165  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  31.55 
 
 
355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  30.98 
 
 
366 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  33.33 
 
 
341 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  31.62 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  31.39 
 
 
355 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  30.7 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  30.03 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  31.2 
 
 
354 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  32.73 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  30.94 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  27.07 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  27.63 
 
 
374 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  26.27 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  26.81 
 
 
356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  30.59 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  27.84 
 
 
344 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 
351 aa  106  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  22.22 
 
 
367 aa  99.4  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  24.7 
 
 
344 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  22.64 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  25.47 
 
 
374 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  23.97 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  23.97 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2984  sporulation integral membrane protein YtvI  31.44 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  25 
 
 
415 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  25 
 
 
418 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  26.1 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  24.92 
 
 
379 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  26.8 
 
 
363 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  24.4 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.9 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.84 
 
 
390 aa  87.4  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  24.49 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  24.78 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.51 
 
 
388 aa  86.7  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  23.03 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  24.71 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  26.76 
 
 
435 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  21.87 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  21.87 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.31 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  26.54 
 
 
347 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  30.21 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  26.54 
 
 
347 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  22.78 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  24.05 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  23.6 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  26.11 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  24.45 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  22.66 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  22.76 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  23.63 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  25.38 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.47 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.7 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  21.96 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  21.96 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  21.96 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  21.96 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  21.96 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  22.39 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.15 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.72 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  21.36 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0427  sporulation integral membrane protein YtvI  21.65 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.55 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.22 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  23.1 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.7 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  21.3 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  21.3 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.7 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  25.07 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.61 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.61 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  21.3 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  22.51 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  24.66 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  22.51 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.78 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  22.96 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>