More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2925 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 222 aa  430  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.17 
 
 		 222 aa  325  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.07 
 
 		 222 aa  318  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.27 
 
 		 222 aa  314  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.04 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.83 
 
 		 221 aa  274  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0124248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5128  ABC transporter, permease protein  76.92 
 
 		 221 aa  268  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0112  ABC transporter, permease protein  76.92 
 
 		 221 aa  268  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0198801  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5124  ABC transporter, permease protein  77.38 
 
 		 221 aa  266  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0134076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5126  ABC transporter, permease protein  77.38 
 
 		 221 aa  266  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0592267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.02 
 
 		 221 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4854  ABC transporter permease  77.83 
 
 		 223 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4695  ABC transporter, permease  77.83 
 
 		 223 aa  260  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00753221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5091  ABC transporter, permease protein  77.83 
 
 		 221 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4710  ABC transporter, permease  77.83 
 
 		 223 aa  260  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5221  ABC transporter permease  77.83 
 
 		 221 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.793852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0490  ABC transporter, permease protein  65.9 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.507412  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.74 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000039198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.74 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00842826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.83 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  48.83 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.88 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.88 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  47.42 
 
 		 231 aa  187  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.29 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.83 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  45.97 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.02 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.72 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  44.83 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  46.98 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.66 
 
 		 228 aa  174  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.04 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  48.06 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.39 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.97 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  46.45 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  46.45 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  46.33 
 
 		 225 aa  171  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.64 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.9 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.28 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6305  ABC transporter permease  50.7 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72630  putative permease of ABC transporter  50.7 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  49.26 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.17 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  49.26 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  49.26 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  49.26 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  49.26 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  49.26 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  46.92 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  42.79 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  46.8 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.31 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 		 246 aa  164  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.64 
 
 		 217 aa  164  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  44.55 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  50 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.95 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529248  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  46.45 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.8 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.26 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  46.85 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  50 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.23 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0066  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.13 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.23 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  48.79 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  46.7 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  46.7 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.26 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  43.6 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.7 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.7 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.7 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.7 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.26 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  43.6 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.7 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.7 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.7 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.44 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>