More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0844 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1739  ABC transporter related protein  68.6 
 
 
516 aa  721    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  100 
 
 
515 aa  1054    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  42.94 
 
 
498 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3218  ABC transporter-related protein  43.17 
 
 
503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0134521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1662  ABC transporter related  43.37 
 
 
503 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0101569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1933  ABC transporter related protein  43.15 
 
 
503 aa  405  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0512785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2520  ABC transporter related  41.05 
 
 
518 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.265677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2423  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
513 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2415  ABC transporter related  41.94 
 
 
503 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.543063  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2315  ABC transporter related  42.14 
 
 
503 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0829639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1135  ABC transporter related  40.32 
 
 
500 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.33 
 
 
503 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  40 
 
 
506 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.64 
 
 
501 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  39.44 
 
 
509 aa  363  6e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  39.44 
 
 
520 aa  362  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40.04 
 
 
494 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  40.96 
 
 
499 aa  360  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0660  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  37.8 
 
 
497 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  38.55 
 
 
500 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  39.76 
 
 
509 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 
494 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0664  ABC transporter related  38.99 
 
 
495 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  38.83 
 
 
516 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.51 
 
 
496 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  38.34 
 
 
515 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2159  ABC transporter related  38.89 
 
 
500 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.634503  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  38.55 
 
 
500 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  37.65 
 
 
514 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  37.65 
 
 
514 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  37.65 
 
 
514 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  38.1 
 
 
520 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  37.6 
 
 
499 aa  353  5.9999999999999994e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  37.35 
 
 
519 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
494 aa  352  7e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0908  methylthioribose transport ATP-binding protein  38.98 
 
 
494 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  39.35 
 
 
506 aa  352  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 
494 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.48 
 
 
499 aa  352  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
499 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 
494 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.3 
 
 
501 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.48 
 
 
499 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  38.48 
 
 
499 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  38.2 
 
 
505 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  37.2 
 
 
497 aa  349  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  38.66 
 
 
504 aa  349  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.53 
 
 
495 aa  349  6e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  38.63 
 
 
511 aa  349  8e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  39.39 
 
 
511 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  39.07 
 
 
514 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  37.98 
 
 
517 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.95 
 
 
516 aa  346  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  37.33 
 
 
506 aa  346  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  38.88 
 
 
516 aa  346  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  36.65 
 
 
504 aa  345  8e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  38.05 
 
 
512 aa  345  8.999999999999999e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  37.3 
 
 
517 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  38.13 
 
 
497 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  36.16 
 
 
493 aa  345  1e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
494 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  39.18 
 
 
504 aa  343  5e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  38.04 
 
 
508 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.38 
 
 
506 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  37.75 
 
 
506 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  38.26 
 
 
525 aa  342  9e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  37.15 
 
 
511 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  37.55 
 
 
501 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  39.35 
 
 
507 aa  341  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2577  ABC transporter related  38.69 
 
 
507 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 
492 aa  340  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  38.63 
 
 
502 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  38.03 
 
 
498 aa  341  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  37.92 
 
 
502 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  36.82 
 
 
510 aa  341  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2519  ABC transporter related protein  40.04 
 
 
515 aa  341  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  36.79 
 
 
496 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  38.91 
 
 
512 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  39.04 
 
 
511 aa  340  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0503  ABC transporter related  40.8 
 
 
508 aa  340  4e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.689531  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  36.38 
 
 
496 aa  340  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 
507 aa  340  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  38.1 
 
 
509 aa  340  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  39.63 
 
 
502 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  39.02 
 
 
504 aa  339  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  38.06 
 
 
492 aa  339  8e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  37.45 
 
 
498 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  39.15 
 
 
507 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.93 
 
 
506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  37.53 
 
 
503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  38.54 
 
 
506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  39.36 
 
 
512 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  37.75 
 
 
528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  37.53 
 
 
499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  40.16 
 
 
511 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3450  ABC transporter related protein  37.95 
 
 
496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>