262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1832 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  75.82 
 
 		 266 aa  324  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.79 
 
 		 273 aa  288  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.88 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.01 
 
 		 285 aa  284  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.23 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.05 
 
 		 272 aa  252  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  53.91 
 
 		 254 aa  238  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.21 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  48.02 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.78 
 
 		 275 aa  184  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  43.59 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.91 
 
 		 269 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.98 
 
 		 287 aa  174  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  44.44 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  43.23 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  43.28 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.74 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  42.74 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  43.56 
 
 		 266 aa  171  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.22 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  43.11 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.97 
 
 		 261 aa  168  6e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  43.22 
 
 		 247 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  43.22 
 
 		 247 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  41.98 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  44 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  44 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  42.8 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  42.8 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  42.8 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  42.8 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  42.8 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  43.67 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  43.48 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  42.02 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  42.02 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  42.22 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.22 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.78 
 
 		 303 aa  165  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.85 
 
 		 301 aa  164  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2120  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.25 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781552  normal  0.053022 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  43.39 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.92 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.92 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  42.62 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.92 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  41.38 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  42.22 
 
 		 272 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  42.92 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.78 
 
 		 281 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.79 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  42.92 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  42.92 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.17 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.04 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  42.92 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.78 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  42.67 
 
 		 262 aa  161  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.48 
 
 		 262 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.1 
 
 		 281 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.15 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  42.36 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.22 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.4 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.92 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  41.33 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.43 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.48 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  41.33 
 
 		 283 aa  158  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  45.33 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  44.44 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.78 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1684  condensin subunit ScpA  42.29 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.33 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.44 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.33 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  40.25 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  40.44 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.44 
 
 		 291 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  44.44 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  41.81 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.96 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.86 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  41.63 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2261  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.15 
 
 		 299 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.315795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  40.17 
 
 		 296 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2172  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.15 
 
 		 299 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.991171  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.85 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.71 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.25 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.83 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  39.74 
 
 		 301 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  40 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  40.44 
 
 		 291 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  39.67 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  40.89 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  40.89 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>