More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0380 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0380  lipoyl synthase  100 
 
 		 303 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3150  lipoyl synthase  76.87 
 
 		 283 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0399  lipoyl synthase  68.21 
 
 		 283 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0400  lipoyl synthase  69.18 
 
 		 291 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0399  lipoyl synthase  68.1 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.661131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  64.41 
 
 		 281 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2239  lipoyl synthase  63.21 
 
 		 280 aa  349  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  57.61 
 
 		 283 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  51.65 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 291 aa  295  8e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  56.83 
 
 		 296 aa  290  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  53.62 
 
 		 307 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  52.19 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  52.36 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0287  lipoyl synthase  51.81 
 
 		 314 aa  279  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0533885  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 315 aa  278  8e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 329 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 329 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 329 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 329 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  51.23 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  51.45 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  51.57 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  51.81 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  52.5 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 329 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  51.81 
 
 		 329 aa  276  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 321 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 318 aa  275  8e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 339 aa  275  9e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  50.92 
 
 		 288 aa  275  9e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  53.28 
 
 		 326 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  49.29 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  50 
 
 		 291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  51.25 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  48.04 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  50.73 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  50.87 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  49.46 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 288 aa  272  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 326 aa  272  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  52.54 
 
 		 320 aa  272  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  49.46 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 326 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  47.69 
 
 		 300 aa  271  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  53.36 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  48.76 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  48.76 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  52.36 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  49.12 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1049  lipoyl synthase  49.12 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710809  hitchhiker  0.0056856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  49.12 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  50 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  48.73 
 
 		 322 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 287 aa  269  4e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  50 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 323 aa  269  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  48.06 
 
 		 321 aa  269  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 320 aa  268  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0381  lipoyl synthase  47.12 
 
 		 297 aa  268  7e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.224918  hitchhiker  0.0000000000185759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0984  lipoyl synthase  48.76 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.10688  normal  0.0219109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 326 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0988  lipoyl synthase  48.76 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0584288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0401  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 331 aa  268  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  49.08 
 
 		 299 aa  268  8e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  48.24 
 
 		 294 aa  268  8e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  48.76 
 
 		 321 aa  268  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  51.27 
 
 		 309 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>