More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0389 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0389  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 363 aa  739    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.65951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0395  glycine cleavage system T protein  97.25 
 
 		 363 aa  721    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  73.28 
 
 		 362 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  68.87 
 
 		 363 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0375  glycine cleavage system T protein  70.52 
 
 		 362 aa  519  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  67.96 
 
 		 366 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  66.2 
 
 		 363 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1403  glycine cleavage system T protein  48.63 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0786  glycine cleavage system T protein  45.11 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1996  glycine cleavage system T protein  44.66 
 
 		 367 aa  301  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.672194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0341  glycine cleavage system T protein  48.35 
 
 		 362 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  44.48 
 
 		 360 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1559  glycine cleavage system T protein  44.85 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  42.42 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  41.99 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.85 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.13 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  37.78 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.28 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.28 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.71 
 
 		 360 aa  258  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  42.62 
 
 		 371 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.56 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.97 
 
 		 368 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  38.06 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.33 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  41.67 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.36 
 
 		 441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.83 
 
 		 359 aa  252  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.01 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  42.9 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.39 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.4 
 
 		 430 aa  244  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.39 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.16 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  39.04 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.06 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  35.46 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  39.5 
 
 		 375 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.16 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.41 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  42.06 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  36.46 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.84 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  39.12 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  35.47 
 
 		 366 aa  235  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.46 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  40.39 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  39.66 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  36.58 
 
 		 381 aa  232  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.74 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  37.57 
 
 		 360 aa  232  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.97 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.73 
 
 		 363 aa  229  4e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.83 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  37.92 
 
 		 391 aa  229  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.53 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  36.29 
 
 		 364 aa  229  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  38.78 
 
 		 367 aa  228  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  37.64 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.64 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  36.96 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.17 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  42.34 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.12 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  37.43 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  37.23 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  37.23 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.47 
 
 		 376 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.4 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  37.16 
 
 		 373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  41.8 
 
 		 381 aa  225  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  36.68 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  37.5 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.23 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.4 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.36 
 
 		 366 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  36.96 
 
 		 409 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.64 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.36 
 
 		 366 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.36 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  38.38 
 
 		 376 aa  222  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.36 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.36 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.36 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.61 
 
 		 388 aa  222  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.36 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  38.44 
 
 		 389 aa  222  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.81 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.11 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  38.46 
 
 		 375 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  37.78 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  38.11 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  38.42 
 
 		 350 aa  219  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  38.42 
 
 		 367 aa  218  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.52 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.52 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  36.89 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.41 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.34 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>