More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5126 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
291 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  83.51 
 
 
298 aa  484  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1345  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  69.23 
 
 
308 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  hitchhiker  0.000920684 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0991  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  68.29 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232217  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1050  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  68.31 
 
 
312 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2788  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  67.48 
 
 
310 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419297  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.08 
 
 
308 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0444121  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3250  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.2 
 
 
305 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.670776  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5027  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.55 
 
 
298 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.78 
 
 
305 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112199  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3307  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.32 
 
 
300 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1572  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  66.43 
 
 
315 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3109  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  61.27 
 
 
309 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27000  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.49 
 
 
302 aa  345  7e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276058  normal  0.910216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  60.84 
 
 
296 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3198  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  58.19 
 
 
295 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000417891  hitchhiker  0.000803821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.75 
 
 
296 aa  322  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2661  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  55.71 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3032  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.84 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.57 
 
 
300 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  48.57 
 
 
300 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.86 
 
 
300 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1732  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.76 
 
 
301 aa  242  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000245457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2676  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.5 
 
 
300 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  47.55 
 
 
291 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.1 
 
 
294 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.26 
 
 
291 aa  237  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0179817  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.77 
 
 
289 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  46.57 
 
 
300 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.68 
 
 
312 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.01 
 
 
281 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.45 
 
 
281 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.42 
 
 
317 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  43.46 
 
 
276 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.1 
 
 
314 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2896  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.75 
 
 
286 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.09 
 
 
281 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.01 
 
 
281 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.82 
 
 
276 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.11 
 
 
282 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.86 
 
 
311 aa  228  9e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.06 
 
 
276 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.7 
 
 
276 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.46 
 
 
276 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.11 
 
 
295 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.73 
 
 
281 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.09 
 
 
281 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  42.96 
 
 
276 aa  226  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.11 
 
 
290 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.09 
 
 
281 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1081  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  45.71 
 
 
308 aa  225  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517774  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1450  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.48 
 
 
303 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.73 
 
 
302 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1122  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44 
 
 
309 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.476308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.01 
 
 
281 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1723  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.12 
 
 
303 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2028  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.64 
 
 
305 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.48 
 
 
303 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.21 
 
 
304 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302516  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3544  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.22 
 
 
306 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.373461 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.7 
 
 
343 aa  223  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1170  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  46.26 
 
 
298 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0239338  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2916  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.12 
 
 
276 aa  222  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0180  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.75 
 
 
276 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3996  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.05 
 
 
310 aa  221  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4187  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.43 
 
 
292 aa  221  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.14 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.35 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4919  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.22 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4039  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.43 
 
 
296 aa  219  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.29 
 
 
298 aa  219  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0522  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.43 
 
 
296 aa  218  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1765  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.12 
 
 
295 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294804  normal  0.0134903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.83 
 
 
319 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.27 
 
 
276 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.27 
 
 
276 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3208  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  44.24 
 
 
313 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2367  Deleted entry  42.11 
 
 
323 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38264  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0219  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.55 
 
 
310 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.14 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7060  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.45 
 
 
305 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377124  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0256  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.39 
 
 
276 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.81 
 
 
280 aa  215  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1105  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.58 
 
 
293 aa  215  8e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0497695  normal  0.0196735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2833  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.39 
 
 
276 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0274  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.39 
 
 
276 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320742  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.82 
 
 
283 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.52 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3409  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.62 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110257  normal  0.0203193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3377  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.82 
 
 
276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.12 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.28 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1822  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.04 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00652514  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.07 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.35 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4223  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  43.12 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3169  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  41.01 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.03 
 
 
294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.36 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3756  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.18 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>