More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4843 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4843  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
170 aa  335  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11968  oxidoreductase  58.97 
 
 
171 aa  186  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0356349  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4001  flavin reductase domain-containing protein  58.97 
 
 
172 aa  181  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.371931  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4201  flavin reductase domain-containing protein  55.42 
 
 
186 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313285  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  53.69 
 
 
184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2759  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.92 
 
 
193 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0399  flavin reductase domain-containing protein  52.23 
 
 
166 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.312372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0279  flavin reductase domain-containing protein  51.92 
 
 
167 aa  158  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.932981  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10248  oxidoreductase  51.01 
 
 
162 aa  156  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.712736 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0925  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.5 
 
 
173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000199253  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0240  flavin reductase domain-containing protein  51.23 
 
 
161 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695925  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1234  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  50 
 
 
177 aa  149  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3777  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.98 
 
 
165 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0250  flavin reductase-like, FMN-binding protein  50.62 
 
 
161 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0260  flavin reductase domain-containing protein  50.62 
 
 
161 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4310  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.67 
 
 
203 aa  130  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.04 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  44.3 
 
 
207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.05 
 
 
171 aa  114  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  47.77 
 
 
790 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19380  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.56 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.711289  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.51 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  33.13 
 
 
169 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  34.76 
 
 
169 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.76 
 
 
162 aa  101  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  41.25 
 
 
173 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  37.09 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  35.86 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  34.9 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.86 
 
 
311 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  31.29 
 
 
204 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  33.74 
 
 
193 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  37.42 
 
 
161 aa  97.8  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
188 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  38.55 
 
 
168 aa  97.4  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.13 
 
 
311 aa  97.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.3 
 
 
191 aa  97.4  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
188 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  32.47 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  33.33 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  35.92 
 
 
175 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
226 aa  95.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
188 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  35.95 
 
 
172 aa  95.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 
393 aa  94.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  36.42 
 
 
172 aa  94.4  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  38.99 
 
 
430 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.87 
 
 
170 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  37.59 
 
 
311 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  36.65 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  34.15 
 
 
169 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.87 
 
 
188 aa  92  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  33.73 
 
 
175 aa  91.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  37.16 
 
 
172 aa  91.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.32 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  33.75 
 
 
197 aa  90.9  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  34.38 
 
 
162 aa  90.9  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  31.54 
 
 
187 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  31.01 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  33.94 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.03 
 
 
155 aa  90.5  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  36.81 
 
 
226 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  34.42 
 
 
408 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  33.73 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  36.81 
 
 
226 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  33.73 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.89 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  34.78 
 
 
302 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  32.48 
 
 
160 aa  88.6  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  34.19 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  36.6 
 
 
186 aa  88.2  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  32.7 
 
 
175 aa  87.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  34.78 
 
 
306 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  34.56 
 
 
161 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.08 
 
 
190 aa  87  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.55 
 
 
179 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.9 
 
 
191 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  31.33 
 
 
182 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.06 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.87 
 
 
404 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  35.62 
 
 
185 aa  85.5  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  37.2 
 
 
170 aa  84.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
327 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  38.16 
 
 
171 aa  84  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
186 aa  84  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.01 
 
 
169 aa  84  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.25 
 
 
169 aa  84  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  31.76 
 
 
161 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  34.39 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.55 
 
 
157 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  31.08 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  31.45 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.69 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>