More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4832 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  100 
 
 
287 aa  569  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  40.34 
 
 
278 aa  198  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  41.58 
 
 
271 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  39.66 
 
 
282 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  41.3 
 
 
261 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  38.65 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  39.23 
 
 
276 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  35.99 
 
 
275 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  40.44 
 
 
274 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  33.48 
 
 
283 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 
283 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  31 
 
 
382 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 
283 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.21 
 
 
280 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
280 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
286 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  29.34 
 
 
293 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  26.01 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.23 
 
 
305 aa  99.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  28.63 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  28.75 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.42 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  32.04 
 
 
377 aa  93.2  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
267 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  27.52 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  31.03 
 
 
559 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  32.77 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  33.33 
 
 
377 aa  89.7  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  41.75 
 
 
274 aa  89  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  34.23 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  37.42 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
1012 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
270 aa  86.3  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
277 aa  85.5  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  29.36 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  33.77 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  34.73 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  38.1 
 
 
392 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.73 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  30.86 
 
 
365 aa  82.4  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.35 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  26.4 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  39.29 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  28.63 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  37.4 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  36.02 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  37.4 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.69 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 
572 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  32.12 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  27.24 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.38 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  31.84 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  30.38 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  31.84 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.52 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  34.92 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  28.41 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.12 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0457  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.12 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.566128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  34.44 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  29.24 
 
 
776 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  31.97 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  42.34 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  41.44 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  31.29 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.9 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.81 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  26.69 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2619  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188551  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.66 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16375  predicted protein  27.31 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00657234  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.58 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.9 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.9 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.36 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.94 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.23 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.91 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  38.26 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>