More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4769 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4769  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5768  transcriptional regulator, HxlR family  76.19 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1318  transcriptional regulator, HxlR family  65.73 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  57.93 
 
 		 132 aa  157  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  51.56 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  48.46 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  47.66 
 
 		 171 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  47.66 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 154 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  45.24 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  46.77 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  44.78 
 
 		 272 aa  110  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  40.94 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  40.77 
 
 		 135 aa  103  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  38.17 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  43.55 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  47.01 
 
 		 135 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  47.01 
 
 		 135 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  45.08 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  40.8 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  46.22 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  41.88 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  42.97 
 
 		 130 aa  98.2  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  39.83 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  45.22 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  42.19 
 
 		 175 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 180 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 134 aa  96.7  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 130 aa  95.9  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  44.92 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  41.32 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  41.6 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  41.13 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 157 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  41.79 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  43.8 
 
 		 168 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  42.97 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  39.52 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  43.75 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  40.83 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  36.09 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  41.74 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  36.64 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  36.64 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  43.33 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  36.64 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  36.64 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  39.37 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  36.64 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  36.64 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  36.64 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  41.13 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  39.84 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  36.64 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  39.53 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  42.61 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  40.65 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  37.96 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  40.83 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>