More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4536 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4536  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
250 aa  491  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  54.44 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.39 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0483  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.89 
 
 
268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357471  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0442  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.38 
 
 
255 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475404  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.62 
 
 
267 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0272  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.74 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.342358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7536  putative enoyl-CoA hydratase  45.21 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0552  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1056  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.8 
 
 
255 aa  181  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5361  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.82 
 
 
273 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00524739  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.11 
 
 
267 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3862  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.76 
 
 
186 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.47 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
259 aa  131  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
262 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.76 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
257 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
257 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
258 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
264 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
257 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
257 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 
255 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
270 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
257 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
257 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
270 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
264 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
264 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 
270 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 
273 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
267 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
273 aa  121  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
261 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  34.81 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.25 
 
 
663 aa  119  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 
257 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
267 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
270 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.61 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
282 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
259 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
257 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
258 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
256 aa  119  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
257 aa  118  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
258 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 
258 aa  118  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.77 
 
 
260 aa  118  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.38 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
273 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1307  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
262 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2749  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
262 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439722  normal  0.238533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
257 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
259 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
265 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
280 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
277 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
258 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
266 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
259 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.75 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>