More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3899 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  100 
 
 
407 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  62.53 
 
 
418 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  58.08 
 
 
412 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  35.94 
 
 
405 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  35.95 
 
 
406 aa  236  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  34.26 
 
 
406 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  35.31 
 
 
461 aa  225  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  36.95 
 
 
390 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  34.27 
 
 
399 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  33.5 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.87 
 
 
380 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  32.11 
 
 
399 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  31.17 
 
 
421 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  34.26 
 
 
398 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  33.59 
 
 
398 aa  206  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  34.22 
 
 
421 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.44 
 
 
388 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  30.15 
 
 
400 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  32.12 
 
 
397 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  34.05 
 
 
399 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  30.75 
 
 
401 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  34.62 
 
 
404 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6858  cytochrome P450  34.09 
 
 
409 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  34.34 
 
 
404 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.19 
 
 
392 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  34.34 
 
 
404 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  34.48 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  32.76 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  31.9 
 
 
406 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  33.33 
 
 
402 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6896  cytochrome P450  32.14 
 
 
406 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3832  cytochrome P450  34.44 
 
 
396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0796027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  31.55 
 
 
406 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  32.14 
 
 
403 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0903  cytochrome P450  33.24 
 
 
425 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0338626  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  32.11 
 
 
418 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4880  cytochrome P450  30.39 
 
 
450 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4141  cytochrome P450  31.39 
 
 
394 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  32.04 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1854  cytochrome P450  30.53 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259336  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2517  cytochrome P450  33.41 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.51 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  29.17 
 
 
411 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  32.2 
 
 
414 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4033  cytochrome P450  33.04 
 
 
418 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  32.75 
 
 
398 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  28.92 
 
 
411 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  29.43 
 
 
403 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  29.95 
 
 
447 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  31.09 
 
 
396 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  32.77 
 
 
404 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4141  cytochrome P450  32.7 
 
 
429 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.683656  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  30.22 
 
 
387 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  31.47 
 
 
434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  31.25 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1895  cytochrome P450  30.71 
 
 
384 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4052  cytochrome P450  34.23 
 
 
401 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  0.478412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  33.15 
 
 
417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5317  cytochrome P450  29.63 
 
 
451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  33.15 
 
 
406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  30.98 
 
 
404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  30.98 
 
 
404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0388  heme-thiolate monooxygenase, putative  32.07 
 
 
387 aa  166  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  30.69 
 
 
449 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1743  cytochrome P450  33.33 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  31.39 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  34.27 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3533  cytochrome P450  32.16 
 
 
398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  31.93 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  31.65 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  29.26 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  31.44 
 
 
415 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.04 
 
 
426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  33.06 
 
 
417 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2305  cytochrome P450  30.77 
 
 
385 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.378524  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  33.06 
 
 
417 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  31.51 
 
 
398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  31.09 
 
 
405 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  32.31 
 
 
398 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.97 
 
 
398 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  31.05 
 
 
407 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  31.72 
 
 
413 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  33.52 
 
 
408 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  31.75 
 
 
418 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  31.28 
 
 
418 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  31 
 
 
427 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  30.73 
 
 
427 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  31.28 
 
 
418 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  31 
 
 
427 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  31.28 
 
 
418 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  28.43 
 
 
411 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  31.04 
 
 
395 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1259  cytochrome P450  28.4 
 
 
448 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922035  hitchhiker  0.00766496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3663  cytochrome P450  31.69 
 
 
426 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  27.83 
 
 
411 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  27.97 
 
 
411 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3676  cytochrome P450  31.69 
 
 
426 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107339  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3736  cytochrome P450  31.69 
 
 
426 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  28.47 
 
 
411 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4936  cytochrome P450  29.21 
 
 
451 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>