More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3301 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
501 aa  981    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  64.31 
 
 
524 aa  574  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  59.04 
 
 
526 aa  518  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  44.25 
 
 
513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  44.25 
 
 
513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  44.25 
 
 
513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  44.25 
 
 
513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  44.49 
 
 
513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  44.69 
 
 
513 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  44.29 
 
 
513 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  44.49 
 
 
513 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  48.6 
 
 
519 aa  445  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  42.97 
 
 
511 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  44.4 
 
 
514 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  42.77 
 
 
511 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  42.38 
 
 
511 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  44.49 
 
 
512 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  42.57 
 
 
511 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  41.87 
 
 
512 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  42.8 
 
 
512 aa  432  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  41.47 
 
 
512 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  41.87 
 
 
511 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  41.67 
 
 
512 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  44.16 
 
 
530 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  41.58 
 
 
506 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  41.87 
 
 
512 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  52.09 
 
 
530 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  39.6 
 
 
513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  40.59 
 
 
518 aa  405  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  40.59 
 
 
512 aa  395  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  39.01 
 
 
517 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  39.01 
 
 
517 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  38.89 
 
 
509 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  38.59 
 
 
499 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  37.13 
 
 
509 aa  364  2e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  39.68 
 
 
489 aa  360  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  43.58 
 
 
495 aa  353  5e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  46.17 
 
 
476 aa  347  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  34.35 
 
 
502 aa  345  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  38.62 
 
 
486 aa  342  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  45.56 
 
 
513 aa  342  1e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  33.54 
 
 
476 aa  301  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  33.54 
 
 
476 aa  301  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  42.99 
 
 
333 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  38.51 
 
 
509 aa  280  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  35.61 
 
 
496 aa  274  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.06 
 
 
501 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  33.27 
 
 
518 aa  266  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.17 
 
 
500 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  31.23 
 
 
509 aa  260  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  34.26 
 
 
499 aa  258  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  32.15 
 
 
502 aa  250  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  31.78 
 
 
496 aa  250  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  34.06 
 
 
511 aa  248  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.33 
 
 
512 aa  246  6e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  35.34 
 
 
511 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  39.26 
 
 
483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  34.49 
 
 
506 aa  239  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.55 
 
 
492 aa  239  8e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.55 
 
 
492 aa  239  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  36.62 
 
 
498 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  28.43 
 
 
505 aa  237  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  35.08 
 
 
506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  29.36 
 
 
496 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  31.97 
 
 
538 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.67 
 
 
515 aa  231  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  37.06 
 
 
487 aa  229  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  36.64 
 
 
505 aa  229  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  35.17 
 
 
504 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  29.46 
 
 
489 aa  228  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.69 
 
 
503 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  37.63 
 
 
499 aa  227  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  29.92 
 
 
512 aa  226  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  31.94 
 
 
512 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  35.89 
 
 
499 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.36 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  36.5 
 
 
501 aa  219  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  26.64 
 
 
505 aa  220  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  33.02 
 
 
510 aa  220  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.84 
 
 
509 aa  219  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  29.1 
 
 
511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  33.6 
 
 
484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.81 
 
 
499 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  34.58 
 
 
508 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  29.86 
 
 
519 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  29.12 
 
 
497 aa  210  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  33.53 
 
 
511 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  32.81 
 
 
505 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  33.14 
 
 
517 aa  208  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  33.14 
 
 
517 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.81 
 
 
490 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  34.19 
 
 
548 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  32.8 
 
 
493 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  34.04 
 
 
514 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  29.46 
 
 
506 aa  206  8e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  34.97 
 
 
472 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  32.46 
 
 
496 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  33.98 
 
 
514 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  27.93 
 
 
503 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  29.66 
 
 
506 aa  205  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>