25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2301 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  100 
 
 		 365 aa  725    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  69.6 
 
 		 427 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  69.33 
 
 		 430 aa  326  5e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  65.6 
 
 		 266 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  64.68 
 
 		 259 aa  309  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  60 
 
 		 445 aa  292  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  58.64 
 
 		 430 aa  272  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  48.23 
 
 		 254 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  47.96 
 
 		 260 aa  196  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  44.64 
 
 		 264 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  42.31 
 
 		 244 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  39.57 
 
 		 257 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0608  hypothetical protein  40 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  38.52 
 
 		 489 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2020  Pectate lyase  43.75 
 
 		 574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  43.9 
 
 		 233 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  37.2 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1273  Pectate lyase  38.12 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3322  Pectate lyase  35.75 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0988  Pectate lyase  34.78 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  39.13 
 
 		 511 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.09 
 
 		 424 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1373  type III helper protein HrpW1  36.6 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000104079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1184  type III helper protein HrpW1  35.95 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  35.22 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.396388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>