More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3662 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 258 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1071  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.19 
 
 		 258 aa  342  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  63.92 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  63.14 
 
 		 268 aa  310  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  62.02 
 
 		 262 aa  296  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  61.18 
 
 		 259 aa  295  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.35 
 
 		 261 aa  294  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.35 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.63 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.78 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  59.61 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.39 
 
 		 259 aa  284  9e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.47 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.66 
 
 		 262 aa  281  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.78 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.24 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0682  short chain enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 		 285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.04 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.65 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.41 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  44.09 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  44.09 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.48 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 		 257 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.81 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  42.51 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.67 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.87 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.57 
 
 		 259 aa  184  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.55 
 
 		 260 aa  185  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  44.3 
 
 		 262 aa  184  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  43.2 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  42.39 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.15 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.54 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.67 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  43.95 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  43.44 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.52 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.18 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  43.09 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  44.09 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 		 257 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  44.7 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  41.98 
 
 		 662 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  45.02 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  44.08 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.22 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  38.89 
 
 		 663 aa  176  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  44.6 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.56 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  42.51 
 
 		 258 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  42.51 
 
 		 258 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.67 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  42.39 
 
 		 283 aa  174  9e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  44.13 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  44.81 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.51 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  44.13 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>